Protein–RNA interactions for Protein: B1AKI9

ISM1, Isthmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISM1B1AKI9 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ISM1B1AKI9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ISM1B1AKI9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ISM1B1AKI9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ISM1B1AKI9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ISM1B1AKI9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ISM1B1AKI9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ISM1B1AKI9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ISM1B1AKI9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ISM1B1AKI9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ISM1B1AKI9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ISM1B1AKI9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ISM1B1AKI9 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ISM1B1AKI9 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ISM1B1AKI9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ISM1B1AKI9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ISM1B1AKI9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ISM1B1AKI9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ISM1B1AKI9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ISM1B1AKI9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ISM1B1AKI9 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ISM1B1AKI9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ISM1B1AKI9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ISM1B1AKI9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ISM1B1AKI9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ISM1B1AKI9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ISM1B1AKI9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ISM1B1AKI9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ISM1B1AKI9 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ISM1B1AKI9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ISM1B1AKI9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ISM1B1AKI9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ISM1B1AKI9 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ISM1B1AKI9 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ISM1B1AKI9 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ISM1B1AKI9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ISM1B1AKI9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ISM1B1AKI9 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ISM1B1AKI9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ISM1B1AKI9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ISM1B1AKI9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ISM1B1AKI9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ISM1B1AKI9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ISM1B1AKI9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ISM1B1AKI9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ISM1B1AKI9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ISM1B1AKI9 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ISM1B1AKI9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ISM1B1AKI9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ISM1B1AKI9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ISM1B1AKI9 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ISM1B1AKI9 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ISM1B1AKI9 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ISM1B1AKI9 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ISM1B1AKI9 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ISM1B1AKI9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ISM1B1AKI9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ISM1B1AKI9 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ISM1B1AKI9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ISM1B1AKI9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ISM1B1AKI9 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ISM1B1AKI9 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ISM1B1AKI9 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ISM1B1AKI9 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ISM1B1AKI9 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ISM1B1AKI9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ISM1B1AKI9 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ISM1B1AKI9 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ISM1B1AKI9 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ISM1B1AKI9 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ISM1B1AKI9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ISM1B1AKI9 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ISM1B1AKI9 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ISM1B1AKI9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ISM1B1AKI9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ISM1B1AKI9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ISM1B1AKI9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ISM1B1AKI9 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ISM1B1AKI9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ISM1B1AKI9 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ISM1B1AKI9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ISM1B1AKI9 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ISM1B1AKI9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ISM1B1AKI9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ISM1B1AKI9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ISM1B1AKI9 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ISM1B1AKI9 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ISM1B1AKI9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ISM1B1AKI9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ISM1B1AKI9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ISM1B1AKI9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ISM1B1AKI9 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ISM1B1AKI9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ISM1B1AKI9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ISM1B1AKI9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ISM1B1AKI9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ISM1B1AKI9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ISM1B1AKI9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ISM1B1AKI9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ISM1B1AKI9 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms