Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF7

Plcb2, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plcb2A3KGF7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Plcb2A3KGF7 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Plcb2A3KGF7 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Plcb2A3KGF7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Plcb2A3KGF7 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Plcb2A3KGF7 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Plcb2A3KGF7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Plcb2A3KGF7 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Plcb2A3KGF7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Plcb2A3KGF7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Plcb2A3KGF7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Plcb2A3KGF7 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Plcb2A3KGF7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Plcb2A3KGF7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Plcb2A3KGF7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Plcb2A3KGF7 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Plcb2A3KGF7 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Plcb2A3KGF7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Plcb2A3KGF7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Plcb2A3KGF7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Plcb2A3KGF7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Plcb2A3KGF7 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Plcb2A3KGF7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Plcb2A3KGF7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Plcb2A3KGF7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Plcb2A3KGF7 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Plcb2A3KGF7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Plcb2A3KGF7 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Plcb2A3KGF7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Plcb2A3KGF7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Plcb2A3KGF7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Plcb2A3KGF7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Plcb2A3KGF7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Plcb2A3KGF7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Plcb2A3KGF7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Plcb2A3KGF7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Plcb2A3KGF7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Plcb2A3KGF7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Plcb2A3KGF7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Plcb2A3KGF7 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Plcb2A3KGF7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Plcb2A3KGF7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Plcb2A3KGF7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Plcb2A3KGF7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Plcb2A3KGF7 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Plcb2A3KGF7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Plcb2A3KGF7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Plcb2A3KGF7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Plcb2A3KGF7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Plcb2A3KGF7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Plcb2A3KGF7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Plcb2A3KGF7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Plcb2A3KGF7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Plcb2A3KGF7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Plcb2A3KGF7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Plcb2A3KGF7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Plcb2A3KGF7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Plcb2A3KGF7 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Plcb2A3KGF7 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Plcb2A3KGF7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Plcb2A3KGF7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Plcb2A3KGF7 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Plcb2A3KGF7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Plcb2A3KGF7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Plcb2A3KGF7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Plcb2A3KGF7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Plcb2A3KGF7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Plcb2A3KGF7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Plcb2A3KGF7 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Plcb2A3KGF7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Plcb2A3KGF7 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Plcb2A3KGF7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Plcb2A3KGF7 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Plcb2A3KGF7 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Plcb2A3KGF7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Plcb2A3KGF7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Plcb2A3KGF7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Plcb2A3KGF7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Plcb2A3KGF7 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Plcb2A3KGF7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Plcb2A3KGF7 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Plcb2A3KGF7 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Plcb2A3KGF7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Plcb2A3KGF7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Plcb2A3KGF7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Plcb2A3KGF7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Plcb2A3KGF7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Plcb2A3KGF7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Plcb2A3KGF7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Plcb2A3KGF7 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Plcb2A3KGF7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Plcb2A3KGF7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Plcb2A3KGF7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Plcb2A3KGF7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Plcb2A3KGF7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Plcb2A3KGF7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Plcb2A3KGF7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Plcb2A3KGF7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Plcb2A3KGF7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Plcb2A3KGF7 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.5 ms