Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Frmpd4A2AFR3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Frmpd4A2AFR3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Frmpd4A2AFR3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Frmpd4A2AFR3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Frmpd4A2AFR3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Frmpd4A2AFR3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Frmpd4A2AFR3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Frmpd4A2AFR3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Frmpd4A2AFR3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Frmpd4A2AFR3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Frmpd4A2AFR3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Frmpd4A2AFR3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Frmpd4A2AFR3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Frmpd4A2AFR3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Frmpd4A2AFR3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Frmpd4A2AFR3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Frmpd4A2AFR3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Frmpd4A2AFR3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Frmpd4A2AFR3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Frmpd4A2AFR3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Frmpd4A2AFR3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Frmpd4A2AFR3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Frmpd4A2AFR3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Frmpd4A2AFR3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Frmpd4A2AFR3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Frmpd4A2AFR3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Frmpd4A2AFR3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Frmpd4A2AFR3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Frmpd4A2AFR3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Frmpd4A2AFR3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Frmpd4A2AFR3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Frmpd4A2AFR3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Frmpd4A2AFR3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Frmpd4A2AFR3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Frmpd4A2AFR3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Frmpd4A2AFR3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Frmpd4A2AFR3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Frmpd4A2AFR3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Frmpd4A2AFR3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Frmpd4A2AFR3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Frmpd4A2AFR3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Frmpd4A2AFR3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Frmpd4A2AFR3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Frmpd4A2AFR3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Frmpd4A2AFR3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Frmpd4A2AFR3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Frmpd4A2AFR3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Frmpd4A2AFR3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Frmpd4A2AFR3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Frmpd4A2AFR3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Frmpd4A2AFR3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Frmpd4A2AFR3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Frmpd4A2AFR3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Frmpd4A2AFR3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Frmpd4A2AFR3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Frmpd4A2AFR3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Frmpd4A2AFR3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Frmpd4A2AFR3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Frmpd4A2AFR3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Frmpd4A2AFR3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Frmpd4A2AFR3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Frmpd4A2AFR3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Frmpd4A2AFR3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Frmpd4A2AFR3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Frmpd4A2AFR3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Frmpd4A2AFR3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Frmpd4A2AFR3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Frmpd4A2AFR3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Frmpd4A2AFR3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Frmpd4A2AFR3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Frmpd4A2AFR3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Frmpd4A2AFR3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Frmpd4A2AFR3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Frmpd4A2AFR3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Frmpd4A2AFR3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Frmpd4A2AFR3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Frmpd4A2AFR3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Frmpd4A2AFR3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Frmpd4A2AFR3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Frmpd4A2AFR3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Frmpd4A2AFR3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Frmpd4A2AFR3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Frmpd4A2AFR3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Frmpd4A2AFR3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Frmpd4A2AFR3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Frmpd4A2AFR3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Frmpd4A2AFR3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Frmpd4A2AFR3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Frmpd4A2AFR3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Frmpd4A2AFR3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Frmpd4A2AFR3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Frmpd4A2AFR3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Frmpd4A2AFR3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Frmpd4A2AFR3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Frmpd4A2AFR3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Frmpd4A2AFR3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Frmpd4A2AFR3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Frmpd4A2AFR3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Frmpd4A2AFR3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms