Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Top3bQ9Z321 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Top3bQ9Z321 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Top3bQ9Z321 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Top3bQ9Z321 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Top3bQ9Z321 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Top3bQ9Z321 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Top3bQ9Z321 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Top3bQ9Z321 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Top3bQ9Z321 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Top3bQ9Z321 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Top3bQ9Z321 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Top3bQ9Z321 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Top3bQ9Z321 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Top3bQ9Z321 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Top3bQ9Z321 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Top3bQ9Z321 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Top3bQ9Z321 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Top3bQ9Z321 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Top3bQ9Z321 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Top3bQ9Z321 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Top3bQ9Z321 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Top3bQ9Z321 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Top3bQ9Z321 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Top3bQ9Z321 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Top3bQ9Z321 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Top3bQ9Z321 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Top3bQ9Z321 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Top3bQ9Z321 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Top3bQ9Z321 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Top3bQ9Z321 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Top3bQ9Z321 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Top3bQ9Z321 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Top3bQ9Z321 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Top3bQ9Z321 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Top3bQ9Z321 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Top3bQ9Z321 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Top3bQ9Z321 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Top3bQ9Z321 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Top3bQ9Z321 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Top3bQ9Z321 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Top3bQ9Z321 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Top3bQ9Z321 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Top3bQ9Z321 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Top3bQ9Z321 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Top3bQ9Z321 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Top3bQ9Z321 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Top3bQ9Z321 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Top3bQ9Z321 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Top3bQ9Z321 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Top3bQ9Z321 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Top3bQ9Z321 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Top3bQ9Z321 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Top3bQ9Z321 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Top3bQ9Z321 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Top3bQ9Z321 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Top3bQ9Z321 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Top3bQ9Z321 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Top3bQ9Z321 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Top3bQ9Z321 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Top3bQ9Z321 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Top3bQ9Z321 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Top3bQ9Z321 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Top3bQ9Z321 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Top3bQ9Z321 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Top3bQ9Z321 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Top3bQ9Z321 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Top3bQ9Z321 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Top3bQ9Z321 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Top3bQ9Z321 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Top3bQ9Z321 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Top3bQ9Z321 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Top3bQ9Z321 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Top3bQ9Z321 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Top3bQ9Z321 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Top3bQ9Z321 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Top3bQ9Z321 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Top3bQ9Z321 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Top3bQ9Z321 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Top3bQ9Z321 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Top3bQ9Z321 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Top3bQ9Z321 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Top3bQ9Z321 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Top3bQ9Z321 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Top3bQ9Z321 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Top3bQ9Z321 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Top3bQ9Z321 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Top3bQ9Z321 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Top3bQ9Z321 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Top3bQ9Z321 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Top3bQ9Z321 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Top3bQ9Z321 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Top3bQ9Z321 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Top3bQ9Z321 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Top3bQ9Z321 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Top3bQ9Z321 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Top3bQ9Z321 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Top3bQ9Z321 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Top3bQ9Z321 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Top3bQ9Z321 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms