Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVL1

Ap4s1, AP-4 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4s1Q9WVL1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ap4s1Q9WVL1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ap4s1Q9WVL1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ap4s1Q9WVL1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ap4s1Q9WVL1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ap4s1Q9WVL1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ap4s1Q9WVL1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ap4s1Q9WVL1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ap4s1Q9WVL1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ap4s1Q9WVL1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ap4s1Q9WVL1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ap4s1Q9WVL1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ap4s1Q9WVL1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ap4s1Q9WVL1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ap4s1Q9WVL1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ap4s1Q9WVL1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ap4s1Q9WVL1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ap4s1Q9WVL1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ap4s1Q9WVL1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ap4s1Q9WVL1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ap4s1Q9WVL1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ap4s1Q9WVL1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ap4s1Q9WVL1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ap4s1Q9WVL1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ap4s1Q9WVL1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ap4s1Q9WVL1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ap4s1Q9WVL1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ap4s1Q9WVL1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ap4s1Q9WVL1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ap4s1Q9WVL1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ap4s1Q9WVL1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ap4s1Q9WVL1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ap4s1Q9WVL1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ap4s1Q9WVL1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ap4s1Q9WVL1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ap4s1Q9WVL1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ap4s1Q9WVL1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ap4s1Q9WVL1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ap4s1Q9WVL1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ap4s1Q9WVL1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ap4s1Q9WVL1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ap4s1Q9WVL1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ap4s1Q9WVL1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ap4s1Q9WVL1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ap4s1Q9WVL1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ap4s1Q9WVL1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ap4s1Q9WVL1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms