Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sema6cQ9WTM3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sema6cQ9WTM3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sema6cQ9WTM3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sema6cQ9WTM3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Sema6cQ9WTM3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sema6cQ9WTM3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sema6cQ9WTM3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sema6cQ9WTM3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sema6cQ9WTM3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sema6cQ9WTM3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sema6cQ9WTM3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sema6cQ9WTM3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sema6cQ9WTM3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sema6cQ9WTM3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sema6cQ9WTM3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sema6cQ9WTM3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sema6cQ9WTM3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sema6cQ9WTM3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sema6cQ9WTM3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sema6cQ9WTM3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sema6cQ9WTM3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sema6cQ9WTM3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sema6cQ9WTM3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sema6cQ9WTM3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sema6cQ9WTM3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sema6cQ9WTM3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Sema6cQ9WTM3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sema6cQ9WTM3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Sema6cQ9WTM3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sema6cQ9WTM3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sema6cQ9WTM3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sema6cQ9WTM3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sema6cQ9WTM3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sema6cQ9WTM3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sema6cQ9WTM3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sema6cQ9WTM3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sema6cQ9WTM3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sema6cQ9WTM3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sema6cQ9WTM3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sema6cQ9WTM3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sema6cQ9WTM3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Sema6cQ9WTM3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sema6cQ9WTM3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sema6cQ9WTM3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sema6cQ9WTM3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sema6cQ9WTM3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sema6cQ9WTM3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sema6cQ9WTM3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sema6cQ9WTM3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sema6cQ9WTM3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sema6cQ9WTM3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sema6cQ9WTM3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sema6cQ9WTM3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sema6cQ9WTM3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sema6cQ9WTM3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sema6cQ9WTM3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sema6cQ9WTM3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sema6cQ9WTM3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sema6cQ9WTM3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sema6cQ9WTM3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sema6cQ9WTM3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sema6cQ9WTM3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Sema6cQ9WTM3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sema6cQ9WTM3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Sema6cQ9WTM3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sema6cQ9WTM3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sema6cQ9WTM3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sema6cQ9WTM3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sema6cQ9WTM3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sema6cQ9WTM3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sema6cQ9WTM3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sema6cQ9WTM3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Sema6cQ9WTM3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sema6cQ9WTM3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sema6cQ9WTM3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sema6cQ9WTM3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sema6cQ9WTM3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sema6cQ9WTM3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sema6cQ9WTM3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sema6cQ9WTM3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sema6cQ9WTM3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sema6cQ9WTM3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sema6cQ9WTM3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sema6cQ9WTM3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sema6cQ9WTM3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sema6cQ9WTM3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sema6cQ9WTM3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sema6cQ9WTM3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sema6cQ9WTM3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sema6cQ9WTM3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sema6cQ9WTM3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sema6cQ9WTM3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Sema6cQ9WTM3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sema6cQ9WTM3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sema6cQ9WTM3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sema6cQ9WTM3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sema6cQ9WTM3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sema6cQ9WTM3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sema6cQ9WTM3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms