Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA2

FBXL4, F-box/LRR-repeat protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL4Q9UKA2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXL4Q9UKA2 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXL4Q9UKA2 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXL4Q9UKA2 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXL4Q9UKA2 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXL4Q9UKA2 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXL4Q9UKA2 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXL4Q9UKA2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXL4Q9UKA2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXL4Q9UKA2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXL4Q9UKA2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXL4Q9UKA2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXL4Q9UKA2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXL4Q9UKA2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXL4Q9UKA2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXL4Q9UKA2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXL4Q9UKA2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXL4Q9UKA2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXL4Q9UKA2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXL4Q9UKA2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXL4Q9UKA2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXL4Q9UKA2 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXL4Q9UKA2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXL4Q9UKA2 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXL4Q9UKA2 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXL4Q9UKA2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXL4Q9UKA2 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXL4Q9UKA2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXL4Q9UKA2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXL4Q9UKA2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXL4Q9UKA2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXL4Q9UKA2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXL4Q9UKA2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXL4Q9UKA2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXL4Q9UKA2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXL4Q9UKA2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXL4Q9UKA2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXL4Q9UKA2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXL4Q9UKA2 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXL4Q9UKA2 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXL4Q9UKA2 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXL4Q9UKA2 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXL4Q9UKA2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXL4Q9UKA2 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXL4Q9UKA2 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXL4Q9UKA2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXL4Q9UKA2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXL4Q9UKA2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXL4Q9UKA2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXL4Q9UKA2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXL4Q9UKA2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXL4Q9UKA2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXL4Q9UKA2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXL4Q9UKA2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXL4Q9UKA2 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXL4Q9UKA2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FBXL4Q9UKA2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
FBXL4Q9UKA2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FBXL4Q9UKA2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FBXL4Q9UKA2 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
FBXL4Q9UKA2 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FBXL4Q9UKA2 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FBXL4Q9UKA2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FBXL4Q9UKA2 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FBXL4Q9UKA2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FBXL4Q9UKA2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FBXL4Q9UKA2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
FBXL4Q9UKA2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FBXL4Q9UKA2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FBXL4Q9UKA2 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FBXL4Q9UKA2 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FBXL4Q9UKA2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FBXL4Q9UKA2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FBXL4Q9UKA2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FBXL4Q9UKA2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FBXL4Q9UKA2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FBXL4Q9UKA2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FBXL4Q9UKA2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FBXL4Q9UKA2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FBXL4Q9UKA2 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FBXL4Q9UKA2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FBXL4Q9UKA2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FBXL4Q9UKA2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FBXL4Q9UKA2 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FBXL4Q9UKA2 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
FBXL4Q9UKA2 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FBXL4Q9UKA2 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FBXL4Q9UKA2 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FBXL4Q9UKA2 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FBXL4Q9UKA2 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FBXL4Q9UKA2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
FBXL4Q9UKA2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FBXL4Q9UKA2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms