Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS8

Sh2d3c, SH2 domain-containing protein 3C, mousemouse

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d3cQ9QZS8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh2d3cQ9QZS8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh2d3cQ9QZS8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh2d3cQ9QZS8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh2d3cQ9QZS8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh2d3cQ9QZS8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh2d3cQ9QZS8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh2d3cQ9QZS8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh2d3cQ9QZS8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh2d3cQ9QZS8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh2d3cQ9QZS8 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh2d3cQ9QZS8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh2d3cQ9QZS8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh2d3cQ9QZS8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh2d3cQ9QZS8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh2d3cQ9QZS8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh2d3cQ9QZS8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh2d3cQ9QZS8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh2d3cQ9QZS8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh2d3cQ9QZS8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh2d3cQ9QZS8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh2d3cQ9QZS8 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh2d3cQ9QZS8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh2d3cQ9QZS8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh2d3cQ9QZS8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh2d3cQ9QZS8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh2d3cQ9QZS8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh2d3cQ9QZS8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh2d3cQ9QZS8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh2d3cQ9QZS8 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh2d3cQ9QZS8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh2d3cQ9QZS8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh2d3cQ9QZS8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh2d3cQ9QZS8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh2d3cQ9QZS8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh2d3cQ9QZS8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh2d3cQ9QZS8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh2d3cQ9QZS8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh2d3cQ9QZS8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh2d3cQ9QZS8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh2d3cQ9QZS8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh2d3cQ9QZS8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh2d3cQ9QZS8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh2d3cQ9QZS8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh2d3cQ9QZS8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh2d3cQ9QZS8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh2d3cQ9QZS8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh2d3cQ9QZS8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh2d3cQ9QZS8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh2d3cQ9QZS8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh2d3cQ9QZS8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh2d3cQ9QZS8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh2d3cQ9QZS8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh2d3cQ9QZS8 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh2d3cQ9QZS8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh2d3cQ9QZS8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh2d3cQ9QZS8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh2d3cQ9QZS8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh2d3cQ9QZS8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh2d3cQ9QZS8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh2d3cQ9QZS8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh2d3cQ9QZS8 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh2d3cQ9QZS8 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh2d3cQ9QZS8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh2d3cQ9QZS8 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh2d3cQ9QZS8 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh2d3cQ9QZS8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh2d3cQ9QZS8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh2d3cQ9QZS8 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh2d3cQ9QZS8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh2d3cQ9QZS8 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh2d3cQ9QZS8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh2d3cQ9QZS8 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh2d3cQ9QZS8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh2d3cQ9QZS8 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh2d3cQ9QZS8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh2d3cQ9QZS8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh2d3cQ9QZS8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh2d3cQ9QZS8 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh2d3cQ9QZS8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sh2d3cQ9QZS8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Sh2d3cQ9QZS8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh2d3cQ9QZS8 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh2d3cQ9QZS8 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh2d3cQ9QZS8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh2d3cQ9QZS8 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh2d3cQ9QZS8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh2d3cQ9QZS8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh2d3cQ9QZS8 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh2d3cQ9QZS8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh2d3cQ9QZS8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh2d3cQ9QZS8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh2d3cQ9QZS8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh2d3cQ9QZS8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh2d3cQ9QZS8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh2d3cQ9QZS8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh2d3cQ9QZS8 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms