Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR46

SH3GLB2, Endophilin-B2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GLB2Q9NR46 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SH3GLB2Q9NR46 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SH3GLB2Q9NR46 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SH3GLB2Q9NR46 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SH3GLB2Q9NR46 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SH3GLB2Q9NR46 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH3GLB2Q9NR46 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH3GLB2Q9NR46 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH3GLB2Q9NR46 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH3GLB2Q9NR46 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH3GLB2Q9NR46 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH3GLB2Q9NR46 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SH3GLB2Q9NR46 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH3GLB2Q9NR46 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH3GLB2Q9NR46 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH3GLB2Q9NR46 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH3GLB2Q9NR46 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH3GLB2Q9NR46 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH3GLB2Q9NR46 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH3GLB2Q9NR46 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SH3GLB2Q9NR46 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SH3GLB2Q9NR46 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SH3GLB2Q9NR46 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SH3GLB2Q9NR46 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SH3GLB2Q9NR46 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SH3GLB2Q9NR46 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SH3GLB2Q9NR46 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SH3GLB2Q9NR46 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SH3GLB2Q9NR46 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SH3GLB2Q9NR46 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SH3GLB2Q9NR46 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SH3GLB2Q9NR46 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SH3GLB2Q9NR46 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SH3GLB2Q9NR46 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SH3GLB2Q9NR46 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SH3GLB2Q9NR46 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SH3GLB2Q9NR46 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH3GLB2Q9NR46 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH3GLB2Q9NR46 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH3GLB2Q9NR46 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH3GLB2Q9NR46 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SH3GLB2Q9NR46 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SH3GLB2Q9NR46 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SH3GLB2Q9NR46 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SH3GLB2Q9NR46 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SH3GLB2Q9NR46 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SH3GLB2Q9NR46 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SH3GLB2Q9NR46 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SH3GLB2Q9NR46 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SH3GLB2Q9NR46 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SH3GLB2Q9NR46 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SH3GLB2Q9NR46 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SH3GLB2Q9NR46 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SH3GLB2Q9NR46 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SH3GLB2Q9NR46 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SH3GLB2Q9NR46 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SH3GLB2Q9NR46 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SH3GLB2Q9NR46 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SH3GLB2Q9NR46 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SH3GLB2Q9NR46 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SH3GLB2Q9NR46 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SH3GLB2Q9NR46 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SH3GLB2Q9NR46 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SH3GLB2Q9NR46 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SH3GLB2Q9NR46 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SH3GLB2Q9NR46 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SH3GLB2Q9NR46 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SH3GLB2Q9NR46 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SH3GLB2Q9NR46 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SH3GLB2Q9NR46 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SH3GLB2Q9NR46 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SH3GLB2Q9NR46 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SH3GLB2Q9NR46 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SH3GLB2Q9NR46 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SH3GLB2Q9NR46 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SH3GLB2Q9NR46 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SH3GLB2Q9NR46 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SH3GLB2Q9NR46 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SH3GLB2Q9NR46 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SH3GLB2Q9NR46 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SH3GLB2Q9NR46 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SH3GLB2Q9NR46 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SH3GLB2Q9NR46 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SH3GLB2Q9NR46 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SH3GLB2Q9NR46 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SH3GLB2Q9NR46 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SH3GLB2Q9NR46 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SH3GLB2Q9NR46 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SH3GLB2Q9NR46 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SH3GLB2Q9NR46 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SH3GLB2Q9NR46 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SH3GLB2Q9NR46 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SH3GLB2Q9NR46 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SH3GLB2Q9NR46 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SH3GLB2Q9NR46 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SH3GLB2Q9NR46 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SH3GLB2Q9NR46 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SH3GLB2Q9NR46 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SH3GLB2Q9NR46 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SH3GLB2Q9NR46 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms