Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR16

CD163L1, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M160, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163L1Q9NR16 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CD163L1Q9NR16 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CD163L1Q9NR16 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CD163L1Q9NR16 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CD163L1Q9NR16 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CD163L1Q9NR16 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CD163L1Q9NR16 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CD163L1Q9NR16 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CD163L1Q9NR16 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CD163L1Q9NR16 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CD163L1Q9NR16 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
CD163L1Q9NR16 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CD163L1Q9NR16 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CD163L1Q9NR16 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
CD163L1Q9NR16 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CD163L1Q9NR16 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CD163L1Q9NR16 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CD163L1Q9NR16 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
CD163L1Q9NR16 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CD163L1Q9NR16 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CD163L1Q9NR16 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CD163L1Q9NR16 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CD163L1Q9NR16 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CD163L1Q9NR16 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CD163L1Q9NR16 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CD163L1Q9NR16 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CD163L1Q9NR16 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CD163L1Q9NR16 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CD163L1Q9NR16 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CD163L1Q9NR16 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CD163L1Q9NR16 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CD163L1Q9NR16 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CD163L1Q9NR16 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CD163L1Q9NR16 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CD163L1Q9NR16 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
CD163L1Q9NR16 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CD163L1Q9NR16 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CD163L1Q9NR16 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CD163L1Q9NR16 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CD163L1Q9NR16 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CD163L1Q9NR16 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CD163L1Q9NR16 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CD163L1Q9NR16 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CD163L1Q9NR16 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CD163L1Q9NR16 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CD163L1Q9NR16 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CD163L1Q9NR16 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CD163L1Q9NR16 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CD163L1Q9NR16 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CD163L1Q9NR16 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CD163L1Q9NR16 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CD163L1Q9NR16 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CD163L1Q9NR16 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CD163L1Q9NR16 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CD163L1Q9NR16 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CD163L1Q9NR16 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CD163L1Q9NR16 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CD163L1Q9NR16 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CD163L1Q9NR16 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CD163L1Q9NR16 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CD163L1Q9NR16 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CD163L1Q9NR16 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
CD163L1Q9NR16 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CD163L1Q9NR16 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CD163L1Q9NR16 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CD163L1Q9NR16 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CD163L1Q9NR16 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CD163L1Q9NR16 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CD163L1Q9NR16 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CD163L1Q9NR16 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CD163L1Q9NR16 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CD163L1Q9NR16 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CD163L1Q9NR16 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CD163L1Q9NR16 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CD163L1Q9NR16 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CD163L1Q9NR16 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CD163L1Q9NR16 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CD163L1Q9NR16 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CD163L1Q9NR16 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CD163L1Q9NR16 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CD163L1Q9NR16 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CD163L1Q9NR16 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CD163L1Q9NR16 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CD163L1Q9NR16 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CD163L1Q9NR16 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CD163L1Q9NR16 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CD163L1Q9NR16 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CD163L1Q9NR16 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CD163L1Q9NR16 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CD163L1Q9NR16 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CD163L1Q9NR16 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CD163L1Q9NR16 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CD163L1Q9NR16 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CD163L1Q9NR16 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CD163L1Q9NR16 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CD163L1Q9NR16 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CD163L1Q9NR16 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CD163L1Q9NR16 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CD163L1Q9NR16 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CD163L1Q9NR16 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms