Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mrpl39Q9JKF7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mrpl39Q9JKF7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mrpl39Q9JKF7 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mrpl39Q9JKF7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mrpl39Q9JKF7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mrpl39Q9JKF7 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.8 ms