Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC50

Crot, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrotQ9DC50 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CrotQ9DC50 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CrotQ9DC50 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CrotQ9DC50 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CrotQ9DC50 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CrotQ9DC50 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CrotQ9DC50 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CrotQ9DC50 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CrotQ9DC50 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CrotQ9DC50 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CrotQ9DC50 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CrotQ9DC50 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CrotQ9DC50 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CrotQ9DC50 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CrotQ9DC50 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CrotQ9DC50 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CrotQ9DC50 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CrotQ9DC50 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CrotQ9DC50 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CrotQ9DC50 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CrotQ9DC50 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CrotQ9DC50 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CrotQ9DC50 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CrotQ9DC50 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CrotQ9DC50 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CrotQ9DC50 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CrotQ9DC50 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CrotQ9DC50 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CrotQ9DC50 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CrotQ9DC50 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CrotQ9DC50 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CrotQ9DC50 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CrotQ9DC50 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CrotQ9DC50 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CrotQ9DC50 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CrotQ9DC50 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CrotQ9DC50 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CrotQ9DC50 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CrotQ9DC50 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CrotQ9DC50 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CrotQ9DC50 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CrotQ9DC50 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CrotQ9DC50 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CrotQ9DC50 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CrotQ9DC50 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CrotQ9DC50 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CrotQ9DC50 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CrotQ9DC50 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CrotQ9DC50 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CrotQ9DC50 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CrotQ9DC50 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CrotQ9DC50 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CrotQ9DC50 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CrotQ9DC50 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CrotQ9DC50 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CrotQ9DC50 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CrotQ9DC50 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CrotQ9DC50 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CrotQ9DC50 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CrotQ9DC50 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CrotQ9DC50 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CrotQ9DC50 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CrotQ9DC50 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CrotQ9DC50 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CrotQ9DC50 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CrotQ9DC50 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CrotQ9DC50 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CrotQ9DC50 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CrotQ9DC50 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CrotQ9DC50 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CrotQ9DC50 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CrotQ9DC50 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CrotQ9DC50 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CrotQ9DC50 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CrotQ9DC50 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CrotQ9DC50 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CrotQ9DC50 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CrotQ9DC50 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CrotQ9DC50 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CrotQ9DC50 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CrotQ9DC50 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CrotQ9DC50 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CrotQ9DC50 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CrotQ9DC50 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CrotQ9DC50 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CrotQ9DC50 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CrotQ9DC50 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CrotQ9DC50 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CrotQ9DC50 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CrotQ9DC50 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CrotQ9DC50 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CrotQ9DC50 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CrotQ9DC50 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CrotQ9DC50 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CrotQ9DC50 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CrotQ9DC50 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CrotQ9DC50 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CrotQ9DC50 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CrotQ9DC50 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CrotQ9DC50 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms