Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAR5

1700001F09Rik, RIKEN cDNA 1700001F09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700001F09RikQ9DAR5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700001F09RikQ9DAR5 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700001F09RikQ9DAR5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700001F09RikQ9DAR5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700001F09RikQ9DAR5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700001F09RikQ9DAR5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700001F09RikQ9DAR5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700001F09RikQ9DAR5 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700001F09RikQ9DAR5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700001F09RikQ9DAR5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700001F09RikQ9DAR5 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700001F09RikQ9DAR5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700001F09RikQ9DAR5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700001F09RikQ9DAR5 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700001F09RikQ9DAR5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700001F09RikQ9DAR5 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700001F09RikQ9DAR5 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700001F09RikQ9DAR5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700001F09RikQ9DAR5 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700001F09RikQ9DAR5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700001F09RikQ9DAR5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700001F09RikQ9DAR5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
1700001F09RikQ9DAR5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700001F09RikQ9DAR5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700001F09RikQ9DAR5 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700001F09RikQ9DAR5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700001F09RikQ9DAR5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700001F09RikQ9DAR5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700001F09RikQ9DAR5 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
1700001F09RikQ9DAR5 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700001F09RikQ9DAR5 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700001F09RikQ9DAR5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700001F09RikQ9DAR5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700001F09RikQ9DAR5 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700001F09RikQ9DAR5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700001F09RikQ9DAR5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700001F09RikQ9DAR5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700001F09RikQ9DAR5 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700001F09RikQ9DAR5 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700001F09RikQ9DAR5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700001F09RikQ9DAR5 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
1700001F09RikQ9DAR5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
1700001F09RikQ9DAR5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700001F09RikQ9DAR5 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700001F09RikQ9DAR5 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700001F09RikQ9DAR5 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700001F09RikQ9DAR5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700001F09RikQ9DAR5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700001F09RikQ9DAR5 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700001F09RikQ9DAR5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700001F09RikQ9DAR5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700001F09RikQ9DAR5 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700001F09RikQ9DAR5 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700001F09RikQ9DAR5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700001F09RikQ9DAR5 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700001F09RikQ9DAR5 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700001F09RikQ9DAR5 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700001F09RikQ9DAR5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700001F09RikQ9DAR5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700001F09RikQ9DAR5 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700001F09RikQ9DAR5 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700001F09RikQ9DAR5 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700001F09RikQ9DAR5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700001F09RikQ9DAR5 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700001F09RikQ9DAR5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700001F09RikQ9DAR5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700001F09RikQ9DAR5 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700001F09RikQ9DAR5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700001F09RikQ9DAR5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700001F09RikQ9DAR5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700001F09RikQ9DAR5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700001F09RikQ9DAR5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700001F09RikQ9DAR5 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700001F09RikQ9DAR5 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700001F09RikQ9DAR5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700001F09RikQ9DAR5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700001F09RikQ9DAR5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700001F09RikQ9DAR5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700001F09RikQ9DAR5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700001F09RikQ9DAR5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700001F09RikQ9DAR5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700001F09RikQ9DAR5 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700001F09RikQ9DAR5 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700001F09RikQ9DAR5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700001F09RikQ9DAR5 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700001F09RikQ9DAR5 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700001F09RikQ9DAR5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700001F09RikQ9DAR5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700001F09RikQ9DAR5 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700001F09RikQ9DAR5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700001F09RikQ9DAR5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700001F09RikQ9DAR5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700001F09RikQ9DAR5 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700001F09RikQ9DAR5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700001F09RikQ9DAR5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
1700001F09RikQ9DAR5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700001F09RikQ9DAR5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700001F09RikQ9DAR5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700001F09RikQ9DAR5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700001F09RikQ9DAR5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms