Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PudpQ9D5U5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PudpQ9D5U5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PudpQ9D5U5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PudpQ9D5U5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PudpQ9D5U5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PudpQ9D5U5 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PudpQ9D5U5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PudpQ9D5U5 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PudpQ9D5U5 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PudpQ9D5U5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PudpQ9D5U5 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PudpQ9D5U5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PudpQ9D5U5 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PudpQ9D5U5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PudpQ9D5U5 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PudpQ9D5U5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PudpQ9D5U5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PudpQ9D5U5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PudpQ9D5U5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PudpQ9D5U5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PudpQ9D5U5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PudpQ9D5U5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PudpQ9D5U5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PudpQ9D5U5 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PudpQ9D5U5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PudpQ9D5U5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PudpQ9D5U5 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PudpQ9D5U5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PudpQ9D5U5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PudpQ9D5U5 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PudpQ9D5U5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PudpQ9D5U5 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PudpQ9D5U5 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PudpQ9D5U5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PudpQ9D5U5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PudpQ9D5U5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PudpQ9D5U5 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PudpQ9D5U5 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PudpQ9D5U5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PudpQ9D5U5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PudpQ9D5U5 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PudpQ9D5U5 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PudpQ9D5U5 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PudpQ9D5U5 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PudpQ9D5U5 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PudpQ9D5U5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PudpQ9D5U5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PudpQ9D5U5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PudpQ9D5U5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PudpQ9D5U5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PudpQ9D5U5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PudpQ9D5U5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PudpQ9D5U5 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PudpQ9D5U5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PudpQ9D5U5 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PudpQ9D5U5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PudpQ9D5U5 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PudpQ9D5U5 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PudpQ9D5U5 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms