Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc6bQ9D289 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc6bQ9D289 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc6bQ9D289 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc6bQ9D289 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc6bQ9D289 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc6bQ9D289 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc6bQ9D289 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc6bQ9D289 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc6bQ9D289 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc6bQ9D289 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc6bQ9D289 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc6bQ9D289 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc6bQ9D289 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc6bQ9D289 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc6bQ9D289 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc6bQ9D289 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc6bQ9D289 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc6bQ9D289 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc6bQ9D289 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc6bQ9D289 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc6bQ9D289 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc6bQ9D289 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc6bQ9D289 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc6bQ9D289 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc6bQ9D289 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc6bQ9D289 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc6bQ9D289 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc6bQ9D289 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc6bQ9D289 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc6bQ9D289 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc6bQ9D289 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc6bQ9D289 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc6bQ9D289 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc6bQ9D289 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc6bQ9D289 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc6bQ9D289 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc6bQ9D289 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc6bQ9D289 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc6bQ9D289 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc6bQ9D289 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc6bQ9D289 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc6bQ9D289 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc6bQ9D289 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc6bQ9D289 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc6bQ9D289 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc6bQ9D289 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc6bQ9D289 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc6bQ9D289 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc6bQ9D289 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc6bQ9D289 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc6bQ9D289 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc6bQ9D289 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc6bQ9D289 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc6bQ9D289 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc6bQ9D289 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc6bQ9D289 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc6bQ9D289 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc6bQ9D289 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc6bQ9D289 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc6bQ9D289 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc6bQ9D289 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc6bQ9D289 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc6bQ9D289 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc6bQ9D289 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc6bQ9D289 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc6bQ9D289 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc6bQ9D289 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc6bQ9D289 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc6bQ9D289 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc6bQ9D289 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc6bQ9D289 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc6bQ9D289 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc6bQ9D289 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc6bQ9D289 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc6bQ9D289 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc6bQ9D289 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms