Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZW4

Acsl3, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 720 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsl3Q9CZW4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Acsl3Q9CZW4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Acsl3Q9CZW4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Acsl3Q9CZW4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Acsl3Q9CZW4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Acsl3Q9CZW4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Acsl3Q9CZW4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Acsl3Q9CZW4 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Acsl3Q9CZW4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Acsl3Q9CZW4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Acsl3Q9CZW4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Acsl3Q9CZW4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Acsl3Q9CZW4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Acsl3Q9CZW4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Acsl3Q9CZW4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Acsl3Q9CZW4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Acsl3Q9CZW4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Acsl3Q9CZW4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Acsl3Q9CZW4 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Acsl3Q9CZW4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Acsl3Q9CZW4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Acsl3Q9CZW4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Acsl3Q9CZW4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Acsl3Q9CZW4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Acsl3Q9CZW4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Acsl3Q9CZW4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Acsl3Q9CZW4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Acsl3Q9CZW4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Acsl3Q9CZW4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Acsl3Q9CZW4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Acsl3Q9CZW4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Acsl3Q9CZW4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Acsl3Q9CZW4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Acsl3Q9CZW4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Acsl3Q9CZW4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Acsl3Q9CZW4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Acsl3Q9CZW4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Acsl3Q9CZW4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Acsl3Q9CZW4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Acsl3Q9CZW4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Acsl3Q9CZW4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Acsl3Q9CZW4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Acsl3Q9CZW4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Acsl3Q9CZW4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Acsl3Q9CZW4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Acsl3Q9CZW4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Acsl3Q9CZW4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Acsl3Q9CZW4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Acsl3Q9CZW4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Acsl3Q9CZW4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Acsl3Q9CZW4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Acsl3Q9CZW4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Acsl3Q9CZW4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Acsl3Q9CZW4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Acsl3Q9CZW4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Acsl3Q9CZW4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Acsl3Q9CZW4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Acsl3Q9CZW4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Acsl3Q9CZW4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Acsl3Q9CZW4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Acsl3Q9CZW4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Acsl3Q9CZW4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Acsl3Q9CZW4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Acsl3Q9CZW4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Acsl3Q9CZW4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Acsl3Q9CZW4 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Acsl3Q9CZW4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Acsl3Q9CZW4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Acsl3Q9CZW4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Acsl3Q9CZW4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Acsl3Q9CZW4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Acsl3Q9CZW4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Acsl3Q9CZW4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Acsl3Q9CZW4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Acsl3Q9CZW4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Acsl3Q9CZW4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Acsl3Q9CZW4 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Acsl3Q9CZW4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Acsl3Q9CZW4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Acsl3Q9CZW4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Acsl3Q9CZW4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Acsl3Q9CZW4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Acsl3Q9CZW4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Acsl3Q9CZW4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Acsl3Q9CZW4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Acsl3Q9CZW4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Acsl3Q9CZW4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Acsl3Q9CZW4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Acsl3Q9CZW4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Acsl3Q9CZW4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Acsl3Q9CZW4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Acsl3Q9CZW4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Acsl3Q9CZW4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Acsl3Q9CZW4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Acsl3Q9CZW4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Acsl3Q9CZW4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Acsl3Q9CZW4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Acsl3Q9CZW4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Acsl3Q9CZW4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Acsl3Q9CZW4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms