Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX92

Gje1, Gap junction epsilon-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gje1Q9CX92 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gje1Q9CX92 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gje1Q9CX92 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gje1Q9CX92 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gje1Q9CX92 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gje1Q9CX92 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gje1Q9CX92 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gje1Q9CX92 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gje1Q9CX92 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gje1Q9CX92 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gje1Q9CX92 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gje1Q9CX92 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gje1Q9CX92 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gje1Q9CX92 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gje1Q9CX92 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gje1Q9CX92 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gje1Q9CX92 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gje1Q9CX92 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gje1Q9CX92 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gje1Q9CX92 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gje1Q9CX92 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gje1Q9CX92 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gje1Q9CX92 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gje1Q9CX92 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gje1Q9CX92 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gje1Q9CX92 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gje1Q9CX92 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gje1Q9CX92 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gje1Q9CX92 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gje1Q9CX92 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gje1Q9CX92 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gje1Q9CX92 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gje1Q9CX92 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gje1Q9CX92 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gje1Q9CX92 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gje1Q9CX92 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gje1Q9CX92 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gje1Q9CX92 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gje1Q9CX92 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gje1Q9CX92 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gje1Q9CX92 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gje1Q9CX92 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gje1Q9CX92 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gje1Q9CX92 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gje1Q9CX92 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gje1Q9CX92 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gje1Q9CX92 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gje1Q9CX92 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gje1Q9CX92 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gje1Q9CX92 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gje1Q9CX92 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gje1Q9CX92 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gje1Q9CX92 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gje1Q9CX92 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gje1Q9CX92 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gje1Q9CX92 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gje1Q9CX92 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gje1Q9CX92 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gje1Q9CX92 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gje1Q9CX92 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gje1Q9CX92 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gje1Q9CX92 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gje1Q9CX92 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gje1Q9CX92 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gje1Q9CX92 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gje1Q9CX92 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gje1Q9CX92 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gje1Q9CX92 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gje1Q9CX92 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gje1Q9CX92 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gje1Q9CX92 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gje1Q9CX92 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gje1Q9CX92 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gje1Q9CX92 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gje1Q9CX92 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gje1Q9CX92 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gje1Q9CX92 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gje1Q9CX92 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gje1Q9CX92 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gje1Q9CX92 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gje1Q9CX92 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gje1Q9CX92 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gje1Q9CX92 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gje1Q9CX92 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gje1Q9CX92 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gje1Q9CX92 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gje1Q9CX92 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gje1Q9CX92 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gje1Q9CX92 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gje1Q9CX92 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gje1Q9CX92 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gje1Q9CX92 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gje1Q9CX92 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Gje1Q9CX92 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gje1Q9CX92 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gje1Q9CX92 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gje1Q9CX92 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gje1Q9CX92 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gje1Q9CX92 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gje1Q9CX92 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms