Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX13

Cnih4, Protein cornichon homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih4Q9CX13 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnih4Q9CX13 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnih4Q9CX13 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnih4Q9CX13 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnih4Q9CX13 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnih4Q9CX13 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnih4Q9CX13 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnih4Q9CX13 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnih4Q9CX13 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnih4Q9CX13 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnih4Q9CX13 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnih4Q9CX13 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnih4Q9CX13 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnih4Q9CX13 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnih4Q9CX13 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnih4Q9CX13 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnih4Q9CX13 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnih4Q9CX13 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnih4Q9CX13 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnih4Q9CX13 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnih4Q9CX13 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnih4Q9CX13 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnih4Q9CX13 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnih4Q9CX13 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnih4Q9CX13 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnih4Q9CX13 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnih4Q9CX13 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnih4Q9CX13 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnih4Q9CX13 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnih4Q9CX13 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnih4Q9CX13 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnih4Q9CX13 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnih4Q9CX13 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnih4Q9CX13 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnih4Q9CX13 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnih4Q9CX13 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnih4Q9CX13 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnih4Q9CX13 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnih4Q9CX13 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnih4Q9CX13 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnih4Q9CX13 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnih4Q9CX13 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnih4Q9CX13 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnih4Q9CX13 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnih4Q9CX13 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnih4Q9CX13 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnih4Q9CX13 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnih4Q9CX13 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnih4Q9CX13 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnih4Q9CX13 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnih4Q9CX13 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnih4Q9CX13 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnih4Q9CX13 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnih4Q9CX13 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnih4Q9CX13 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnih4Q9CX13 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnih4Q9CX13 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnih4Q9CX13 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnih4Q9CX13 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnih4Q9CX13 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnih4Q9CX13 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnih4Q9CX13 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnih4Q9CX13 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnih4Q9CX13 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnih4Q9CX13 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnih4Q9CX13 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnih4Q9CX13 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnih4Q9CX13 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnih4Q9CX13 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnih4Q9CX13 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnih4Q9CX13 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnih4Q9CX13 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnih4Q9CX13 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnih4Q9CX13 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnih4Q9CX13 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnih4Q9CX13 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnih4Q9CX13 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnih4Q9CX13 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnih4Q9CX13 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnih4Q9CX13 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnih4Q9CX13 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnih4Q9CX13 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnih4Q9CX13 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnih4Q9CX13 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnih4Q9CX13 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnih4Q9CX13 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnih4Q9CX13 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnih4Q9CX13 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnih4Q9CX13 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnih4Q9CX13 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnih4Q9CX13 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnih4Q9CX13 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnih4Q9CX13 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnih4Q9CX13 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnih4Q9CX13 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnih4Q9CX13 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnih4Q9CX13 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnih4Q9CX13 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnih4Q9CX13 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnih4Q9CX13 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms