Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Utp23Q9CX11 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Utp23Q9CX11 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Utp23Q9CX11 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Utp23Q9CX11 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Utp23Q9CX11 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Utp23Q9CX11 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Utp23Q9CX11 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Utp23Q9CX11 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Utp23Q9CX11 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Utp23Q9CX11 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Utp23Q9CX11 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Utp23Q9CX11 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Utp23Q9CX11 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Utp23Q9CX11 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Utp23Q9CX11 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Utp23Q9CX11 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Utp23Q9CX11 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Utp23Q9CX11 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Utp23Q9CX11 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Utp23Q9CX11 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Utp23Q9CX11 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Utp23Q9CX11 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Utp23Q9CX11 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Utp23Q9CX11 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Utp23Q9CX11 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Utp23Q9CX11 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Utp23Q9CX11 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Utp23Q9CX11 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Utp23Q9CX11 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Utp23Q9CX11 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Utp23Q9CX11 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Utp23Q9CX11 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Utp23Q9CX11 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Utp23Q9CX11 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Utp23Q9CX11 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Utp23Q9CX11 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Utp23Q9CX11 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Utp23Q9CX11 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Utp23Q9CX11 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Utp23Q9CX11 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Utp23Q9CX11 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Utp23Q9CX11 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Utp23Q9CX11 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Utp23Q9CX11 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Utp23Q9CX11 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Utp23Q9CX11 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms