Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9CRC3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9CRC3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9CRC3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q9CRC3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Q9CRC3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q9CRC3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q9CRC3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q9CRC3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q9CRC3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9CRC3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9CRC3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9CRC3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9CRC3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9CRC3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9CRC3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9CRC3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9CRC3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9CRC3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9CRC3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9CRC3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9CRC3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9CRC3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9CRC3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9CRC3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Q9CRC3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9CRC3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9CRC3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Q9CRC3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Q9CRC3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Q9CRC3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Q9CRC3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Q9CRC3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Q9CRC3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q9CRC3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Q9CRC3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q9CRC3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q9CRC3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q9CRC3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q9CRC3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Q9CRC3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Q9CRC3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Q9CRC3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Q9CRC3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Q9CRC3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Q9CRC3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9CRC3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9CRC3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9CRC3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9CRC3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9CRC3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9CRC3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Q9CRC3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9CRC3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9CRC3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9CRC3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9CRC3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9CRC3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9CRC3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9CRC3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9CRC3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9CRC3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9CRC3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9CRC3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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