Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP3

Chchd5, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd5Q9CQP3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms