Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab5aQ9CQD1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab5aQ9CQD1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab5aQ9CQD1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab5aQ9CQD1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab5aQ9CQD1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab5aQ9CQD1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab5aQ9CQD1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab5aQ9CQD1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab5aQ9CQD1 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab5aQ9CQD1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab5aQ9CQD1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab5aQ9CQD1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab5aQ9CQD1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab5aQ9CQD1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab5aQ9CQD1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab5aQ9CQD1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab5aQ9CQD1 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab5aQ9CQD1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab5aQ9CQD1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab5aQ9CQD1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab5aQ9CQD1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab5aQ9CQD1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab5aQ9CQD1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab5aQ9CQD1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab5aQ9CQD1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab5aQ9CQD1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab5aQ9CQD1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab5aQ9CQD1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab5aQ9CQD1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab5aQ9CQD1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab5aQ9CQD1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab5aQ9CQD1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab5aQ9CQD1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab5aQ9CQD1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab5aQ9CQD1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab5aQ9CQD1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab5aQ9CQD1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab5aQ9CQD1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab5aQ9CQD1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab5aQ9CQD1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab5aQ9CQD1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab5aQ9CQD1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab5aQ9CQD1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab5aQ9CQD1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab5aQ9CQD1 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab5aQ9CQD1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab5aQ9CQD1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab5aQ9CQD1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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Rab5aQ9CQD1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab5aQ9CQD1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab5aQ9CQD1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab5aQ9CQD1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab5aQ9CQD1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab5aQ9CQD1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab5aQ9CQD1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab5aQ9CQD1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab5aQ9CQD1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab5aQ9CQD1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab5aQ9CQD1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab5aQ9CQD1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab5aQ9CQD1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab5aQ9CQD1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab5aQ9CQD1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab5aQ9CQD1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab5aQ9CQD1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab5aQ9CQD1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab5aQ9CQD1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab5aQ9CQD1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab5aQ9CQD1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab5aQ9CQD1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab5aQ9CQD1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab5aQ9CQD1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab5aQ9CQD1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab5aQ9CQD1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab5aQ9CQD1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab5aQ9CQD1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab5aQ9CQD1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab5aQ9CQD1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab5aQ9CQD1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab5aQ9CQD1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab5aQ9CQD1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab5aQ9CQD1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab5aQ9CQD1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab5aQ9CQD1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab5aQ9CQD1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab5aQ9CQD1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab5aQ9CQD1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab5aQ9CQD1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab5aQ9CQD1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab5aQ9CQD1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab5aQ9CQD1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab5aQ9CQD1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab5aQ9CQD1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab5aQ9CQD1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab5aQ9CQD1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab5aQ9CQD1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab5aQ9CQD1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab5aQ9CQD1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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