Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA1

Trappc5, Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5Q9CQA1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc5Q9CQA1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc5Q9CQA1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc5Q9CQA1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc5Q9CQA1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc5Q9CQA1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc5Q9CQA1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc5Q9CQA1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc5Q9CQA1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc5Q9CQA1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc5Q9CQA1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc5Q9CQA1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc5Q9CQA1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc5Q9CQA1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc5Q9CQA1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc5Q9CQA1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc5Q9CQA1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc5Q9CQA1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc5Q9CQA1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc5Q9CQA1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc5Q9CQA1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc5Q9CQA1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc5Q9CQA1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc5Q9CQA1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc5Q9CQA1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc5Q9CQA1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc5Q9CQA1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc5Q9CQA1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc5Q9CQA1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc5Q9CQA1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc5Q9CQA1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc5Q9CQA1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc5Q9CQA1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc5Q9CQA1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Trappc5Q9CQA1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Trappc5Q9CQA1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc5Q9CQA1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc5Q9CQA1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc5Q9CQA1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc5Q9CQA1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc5Q9CQA1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc5Q9CQA1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc5Q9CQA1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc5Q9CQA1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc5Q9CQA1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc5Q9CQA1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc5Q9CQA1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc5Q9CQA1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc5Q9CQA1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc5Q9CQA1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc5Q9CQA1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc5Q9CQA1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc5Q9CQA1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc5Q9CQA1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc5Q9CQA1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc5Q9CQA1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc5Q9CQA1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc5Q9CQA1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc5Q9CQA1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc5Q9CQA1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc5Q9CQA1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc5Q9CQA1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc5Q9CQA1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc5Q9CQA1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc5Q9CQA1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc5Q9CQA1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc5Q9CQA1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc5Q9CQA1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc5Q9CQA1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc5Q9CQA1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc5Q9CQA1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc5Q9CQA1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc5Q9CQA1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc5Q9CQA1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc5Q9CQA1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc5Q9CQA1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc5Q9CQA1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc5Q9CQA1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc5Q9CQA1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc5Q9CQA1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc5Q9CQA1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc5Q9CQA1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc5Q9CQA1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc5Q9CQA1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc5Q9CQA1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc5Q9CQA1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc5Q9CQA1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc5Q9CQA1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc5Q9CQA1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc5Q9CQA1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc5Q9CQA1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc5Q9CQA1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc5Q9CQA1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc5Q9CQA1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc5Q9CQA1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc5Q9CQA1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc5Q9CQA1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc5Q9CQA1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc5Q9CQA1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc5Q9CQA1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms