Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ76

Nepn, Nephrocan, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NepnQ9CQ76 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NepnQ9CQ76 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NepnQ9CQ76 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NepnQ9CQ76 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NepnQ9CQ76 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NepnQ9CQ76 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NepnQ9CQ76 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NepnQ9CQ76 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NepnQ9CQ76 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NepnQ9CQ76 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NepnQ9CQ76 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NepnQ9CQ76 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NepnQ9CQ76 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NepnQ9CQ76 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NepnQ9CQ76 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NepnQ9CQ76 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NepnQ9CQ76 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NepnQ9CQ76 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NepnQ9CQ76 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NepnQ9CQ76 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NepnQ9CQ76 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NepnQ9CQ76 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NepnQ9CQ76 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NepnQ9CQ76 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NepnQ9CQ76 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NepnQ9CQ76 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NepnQ9CQ76 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NepnQ9CQ76 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NepnQ9CQ76 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NepnQ9CQ76 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NepnQ9CQ76 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NepnQ9CQ76 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NepnQ9CQ76 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NepnQ9CQ76 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NepnQ9CQ76 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NepnQ9CQ76 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NepnQ9CQ76 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NepnQ9CQ76 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NepnQ9CQ76 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NepnQ9CQ76 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NepnQ9CQ76 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NepnQ9CQ76 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NepnQ9CQ76 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NepnQ9CQ76 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NepnQ9CQ76 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NepnQ9CQ76 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NepnQ9CQ76 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NepnQ9CQ76 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NepnQ9CQ76 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NepnQ9CQ76 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NepnQ9CQ76 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NepnQ9CQ76 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NepnQ9CQ76 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NepnQ9CQ76 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NepnQ9CQ76 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NepnQ9CQ76 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NepnQ9CQ76 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NepnQ9CQ76 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NepnQ9CQ76 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NepnQ9CQ76 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NepnQ9CQ76 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NepnQ9CQ76 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NepnQ9CQ76 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NepnQ9CQ76 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NepnQ9CQ76 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NepnQ9CQ76 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NepnQ9CQ76 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NepnQ9CQ76 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NepnQ9CQ76 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NepnQ9CQ76 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NepnQ9CQ76 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NepnQ9CQ76 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NepnQ9CQ76 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NepnQ9CQ76 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NepnQ9CQ76 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NepnQ9CQ76 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NepnQ9CQ76 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NepnQ9CQ76 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NepnQ9CQ76 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NepnQ9CQ76 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NepnQ9CQ76 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NepnQ9CQ76 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NepnQ9CQ76 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NepnQ9CQ76 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NepnQ9CQ76 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NepnQ9CQ76 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NepnQ9CQ76 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NepnQ9CQ76 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NepnQ9CQ76 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NepnQ9CQ76 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NepnQ9CQ76 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NepnQ9CQ76 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NepnQ9CQ76 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NepnQ9CQ76 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NepnQ9CQ76 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NepnQ9CQ76 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NepnQ9CQ76 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NepnQ9CQ76 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NepnQ9CQ76 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NepnQ9CQ76 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms