Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nsmce3Q9CPR8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nsmce3Q9CPR8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nsmce3Q9CPR8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nsmce3Q9CPR8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nsmce3Q9CPR8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Nsmce3Q9CPR8 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nsmce3Q9CPR8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nsmce3Q9CPR8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nsmce3Q9CPR8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nsmce3Q9CPR8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nsmce3Q9CPR8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nsmce3Q9CPR8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nsmce3Q9CPR8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nsmce3Q9CPR8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nsmce3Q9CPR8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nsmce3Q9CPR8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nsmce3Q9CPR8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nsmce3Q9CPR8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nsmce3Q9CPR8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nsmce3Q9CPR8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nsmce3Q9CPR8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nsmce3Q9CPR8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nsmce3Q9CPR8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nsmce3Q9CPR8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nsmce3Q9CPR8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nsmce3Q9CPR8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nsmce3Q9CPR8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nsmce3Q9CPR8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nsmce3Q9CPR8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nsmce3Q9CPR8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nsmce3Q9CPR8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nsmce3Q9CPR8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nsmce3Q9CPR8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nsmce3Q9CPR8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nsmce3Q9CPR8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nsmce3Q9CPR8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nsmce3Q9CPR8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nsmce3Q9CPR8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nsmce3Q9CPR8 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nsmce3Q9CPR8 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nsmce3Q9CPR8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nsmce3Q9CPR8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nsmce3Q9CPR8 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nsmce3Q9CPR8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nsmce3Q9CPR8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Nsmce3Q9CPR8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nsmce3Q9CPR8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nsmce3Q9CPR8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nsmce3Q9CPR8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nsmce3Q9CPR8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nsmce3Q9CPR8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nsmce3Q9CPR8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nsmce3Q9CPR8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nsmce3Q9CPR8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nsmce3Q9CPR8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Nsmce3Q9CPR8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nsmce3Q9CPR8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nsmce3Q9CPR8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nsmce3Q9CPR8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nsmce3Q9CPR8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nsmce3Q9CPR8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nsmce3Q9CPR8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nsmce3Q9CPR8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nsmce3Q9CPR8 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nsmce3Q9CPR8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nsmce3Q9CPR8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nsmce3Q9CPR8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Nsmce3Q9CPR8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nsmce3Q9CPR8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nsmce3Q9CPR8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nsmce3Q9CPR8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Nsmce3Q9CPR8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Nsmce3Q9CPR8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Nsmce3Q9CPR8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nsmce3Q9CPR8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nsmce3Q9CPR8 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nsmce3Q9CPR8 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nsmce3Q9CPR8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nsmce3Q9CPR8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nsmce3Q9CPR8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nsmce3Q9CPR8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nsmce3Q9CPR8 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nsmce3Q9CPR8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nsmce3Q9CPR8 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nsmce3Q9CPR8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nsmce3Q9CPR8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nsmce3Q9CPR8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nsmce3Q9CPR8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nsmce3Q9CPR8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nsmce3Q9CPR8 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nsmce3Q9CPR8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nsmce3Q9CPR8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nsmce3Q9CPR8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nsmce3Q9CPR8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Nsmce3Q9CPR8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Nsmce3Q9CPR8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Nsmce3Q9CPR8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Nsmce3Q9CPR8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nsmce3Q9CPR8 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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