Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
RNF17Q9BXT8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
RNF17Q9BXT8 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
RNF17Q9BXT8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
RNF17Q9BXT8 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
RNF17Q9BXT8 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
RNF17Q9BXT8 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
RNF17Q9BXT8 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
RNF17Q9BXT8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
RNF17Q9BXT8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
RNF17Q9BXT8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
RNF17Q9BXT8 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
RNF17Q9BXT8 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
RNF17Q9BXT8 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
RNF17Q9BXT8 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
RNF17Q9BXT8 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
RNF17Q9BXT8 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
RNF17Q9BXT8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
RNF17Q9BXT8 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
RNF17Q9BXT8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
RNF17Q9BXT8 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
RNF17Q9BXT8 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
RNF17Q9BXT8 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
RNF17Q9BXT8 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
RNF17Q9BXT8 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
RNF17Q9BXT8 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
RNF17Q9BXT8 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC31.59■■■□□ 2.65
RNF17Q9BXT8 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
RNF17Q9BXT8 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
RNF17Q9BXT8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
RNF17Q9BXT8 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
RNF17Q9BXT8 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
RNF17Q9BXT8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
RNF17Q9BXT8 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
RNF17Q9BXT8 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
RNF17Q9BXT8 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
RNF17Q9BXT8 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
RNF17Q9BXT8 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
RNF17Q9BXT8 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.58■■■□□ 2.65
RNF17Q9BXT8 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
RNF17Q9BXT8 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
RNF17Q9BXT8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
RNF17Q9BXT8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
RNF17Q9BXT8 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.65
RNF17Q9BXT8 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
RNF17Q9BXT8 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
RNF17Q9BXT8 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
RNF17Q9BXT8 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
RNF17Q9BXT8 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
RNF17Q9BXT8 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
RNF17Q9BXT8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
RNF17Q9BXT8 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
RNF17Q9BXT8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
RNF17Q9BXT8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
RNF17Q9BXT8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
RNF17Q9BXT8 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
RNF17Q9BXT8 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
RNF17Q9BXT8 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
RNF17Q9BXT8 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
RNF17Q9BXT8 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
RNF17Q9BXT8 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
RNF17Q9BXT8 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
RNF17Q9BXT8 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
RNF17Q9BXT8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
RNF17Q9BXT8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
RNF17Q9BXT8 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC31.56■■■□□ 2.64
RNF17Q9BXT8 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
RNF17Q9BXT8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
RNF17Q9BXT8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
RNF17Q9BXT8 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
RNF17Q9BXT8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
RNF17Q9BXT8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
RNF17Q9BXT8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
RNF17Q9BXT8 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
RNF17Q9BXT8 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
RNF17Q9BXT8 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
RNF17Q9BXT8 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
RNF17Q9BXT8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
RNF17Q9BXT8 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
RNF17Q9BXT8 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
RNF17Q9BXT8 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
RNF17Q9BXT8 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
RNF17Q9BXT8 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
RNF17Q9BXT8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
RNF17Q9BXT8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
RNF17Q9BXT8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
RNF17Q9BXT8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
RNF17Q9BXT8 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
RNF17Q9BXT8 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
RNF17Q9BXT8 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
RNF17Q9BXT8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
RNF17Q9BXT8 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
RNF17Q9BXT8 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
RNF17Q9BXT8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC31.52■■■□□ 2.64
RNF17Q9BXT8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
RNF17Q9BXT8 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
RNF17Q9BXT8 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
RNF17Q9BXT8 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
RNF17Q9BXT8 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
RNF17Q9BXT8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms