Protein–RNA interactions for Protein: Q99388

Csprs, Component of Sp100-rs, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CsprsQ99388 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 2683.6 ms