Protein–RNA interactions for Protein: Q96B26

EXOSC8, Exosome complex component RRP43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC8Q96B26 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXOSC8Q96B26 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
EXOSC8Q96B26 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXOSC8Q96B26 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXOSC8Q96B26 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXOSC8Q96B26 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXOSC8Q96B26 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXOSC8Q96B26 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXOSC8Q96B26 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXOSC8Q96B26 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXOSC8Q96B26 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXOSC8Q96B26 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXOSC8Q96B26 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXOSC8Q96B26 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXOSC8Q96B26 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXOSC8Q96B26 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXOSC8Q96B26 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXOSC8Q96B26 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXOSC8Q96B26 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXOSC8Q96B26 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
EXOSC8Q96B26 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EXOSC8Q96B26 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EXOSC8Q96B26 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
EXOSC8Q96B26 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EXOSC8Q96B26 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EXOSC8Q96B26 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EXOSC8Q96B26 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
EXOSC8Q96B26 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EXOSC8Q96B26 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EXOSC8Q96B26 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EXOSC8Q96B26 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EXOSC8Q96B26 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EXOSC8Q96B26 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EXOSC8Q96B26 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EXOSC8Q96B26 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EXOSC8Q96B26 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EXOSC8Q96B26 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXOSC8Q96B26 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXOSC8Q96B26 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXOSC8Q96B26 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXOSC8Q96B26 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
EXOSC8Q96B26 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXOSC8Q96B26 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXOSC8Q96B26 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXOSC8Q96B26 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXOSC8Q96B26 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXOSC8Q96B26 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXOSC8Q96B26 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXOSC8Q96B26 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXOSC8Q96B26 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXOSC8Q96B26 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXOSC8Q96B26 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXOSC8Q96B26 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EXOSC8Q96B26 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EXOSC8Q96B26 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EXOSC8Q96B26 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EXOSC8Q96B26 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EXOSC8Q96B26 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EXOSC8Q96B26 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EXOSC8Q96B26 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EXOSC8Q96B26 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EXOSC8Q96B26 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EXOSC8Q96B26 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EXOSC8Q96B26 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EXOSC8Q96B26 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EXOSC8Q96B26 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EXOSC8Q96B26 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EXOSC8Q96B26 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EXOSC8Q96B26 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EXOSC8Q96B26 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EXOSC8Q96B26 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EXOSC8Q96B26 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EXOSC8Q96B26 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EXOSC8Q96B26 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EXOSC8Q96B26 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EXOSC8Q96B26 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
EXOSC8Q96B26 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EXOSC8Q96B26 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EXOSC8Q96B26 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EXOSC8Q96B26 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EXOSC8Q96B26 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EXOSC8Q96B26 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EXOSC8Q96B26 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EXOSC8Q96B26 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EXOSC8Q96B26 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EXOSC8Q96B26 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EXOSC8Q96B26 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EXOSC8Q96B26 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EXOSC8Q96B26 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
EXOSC8Q96B26 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
EXOSC8Q96B26 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
EXOSC8Q96B26 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EXOSC8Q96B26 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EXOSC8Q96B26 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EXOSC8Q96B26 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EXOSC8Q96B26 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EXOSC8Q96B26 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EXOSC8Q96B26 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EXOSC8Q96B26 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EXOSC8Q96B26 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms