Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF4BQ92750 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF4BQ92750 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF4BQ92750 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF4BQ92750 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF4BQ92750 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF4BQ92750 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF4BQ92750 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF4BQ92750 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF4BQ92750 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF4BQ92750 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF4BQ92750 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF4BQ92750 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF4BQ92750 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF4BQ92750 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF4BQ92750 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF4BQ92750 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF4BQ92750 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF4BQ92750 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF4BQ92750 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF4BQ92750 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF4BQ92750 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF4BQ92750 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF4BQ92750 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF4BQ92750 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF4BQ92750 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF4BQ92750 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF4BQ92750 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
TAF4BQ92750 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF4BQ92750 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF4BQ92750 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF4BQ92750 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF4BQ92750 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF4BQ92750 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF4BQ92750 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF4BQ92750 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF4BQ92750 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF4BQ92750 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF4BQ92750 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF4BQ92750 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF4BQ92750 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF4BQ92750 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF4BQ92750 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF4BQ92750 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF4BQ92750 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF4BQ92750 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF4BQ92750 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF4BQ92750 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF4BQ92750 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF4BQ92750 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF4BQ92750 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF4BQ92750 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF4BQ92750 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF4BQ92750 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF4BQ92750 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF4BQ92750 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF4BQ92750 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF4BQ92750 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF4BQ92750 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF4BQ92750 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF4BQ92750 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF4BQ92750 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF4BQ92750 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF4BQ92750 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF4BQ92750 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF4BQ92750 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF4BQ92750 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF4BQ92750 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF4BQ92750 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF4BQ92750 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF4BQ92750 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF4BQ92750 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF4BQ92750 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF4BQ92750 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF4BQ92750 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF4BQ92750 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF4BQ92750 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF4BQ92750 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF4BQ92750 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF4BQ92750 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF4BQ92750 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF4BQ92750 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF4BQ92750 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF4BQ92750 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF4BQ92750 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF4BQ92750 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF4BQ92750 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF4BQ92750 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF4BQ92750 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF4BQ92750 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF4BQ92750 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF4BQ92750 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF4BQ92750 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF4BQ92750 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAF4BQ92750 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAF4BQ92750 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAF4BQ92750 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAF4BQ92750 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAF4BQ92750 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAF4BQ92750 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms