Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4R6

Nup35, Nucleoporin NUP53, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup35Q8R4R6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup35Q8R4R6 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup35Q8R4R6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup35Q8R4R6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup35Q8R4R6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup35Q8R4R6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup35Q8R4R6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup35Q8R4R6 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup35Q8R4R6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup35Q8R4R6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup35Q8R4R6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup35Q8R4R6 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup35Q8R4R6 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup35Q8R4R6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup35Q8R4R6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup35Q8R4R6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup35Q8R4R6 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup35Q8R4R6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup35Q8R4R6 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup35Q8R4R6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup35Q8R4R6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup35Q8R4R6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup35Q8R4R6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup35Q8R4R6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup35Q8R4R6 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup35Q8R4R6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup35Q8R4R6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup35Q8R4R6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup35Q8R4R6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup35Q8R4R6 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup35Q8R4R6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup35Q8R4R6 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup35Q8R4R6 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nup35Q8R4R6 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Nup35Q8R4R6 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nup35Q8R4R6 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nup35Q8R4R6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms