Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r200Q8R281 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r200Q8R281 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r200Q8R281 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r200Q8R281 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r200Q8R281 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r200Q8R281 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r200Q8R281 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r200Q8R281 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r200Q8R281 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r200Q8R281 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r200Q8R281 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Vmn1r200Q8R281 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r200Q8R281 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r200Q8R281 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r200Q8R281 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r200Q8R281 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r200Q8R281 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r200Q8R281 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r200Q8R281 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r200Q8R281 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r200Q8R281 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r200Q8R281 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r200Q8R281 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r200Q8R281 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r200Q8R281 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r200Q8R281 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r200Q8R281 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r200Q8R281 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r200Q8R281 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r200Q8R281 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r200Q8R281 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r200Q8R281 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r200Q8R281 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r200Q8R281 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r200Q8R281 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r200Q8R281 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r200Q8R281 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r200Q8R281 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
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Vmn1r200Q8R281 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r200Q8R281 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r200Q8R281 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r200Q8R281 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r200Q8R281 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r200Q8R281 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r200Q8R281 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r200Q8R281 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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Vmn1r200Q8R281 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r200Q8R281 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r200Q8R281 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r200Q8R281 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r200Q8R281 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r200Q8R281 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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Vmn1r200Q8R281 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r200Q8R281 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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Vmn1r200Q8R281 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r200Q8R281 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
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Vmn1r200Q8R281 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r200Q8R281 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r200Q8R281 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
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Vmn1r200Q8R281 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r200Q8R281 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r200Q8R281 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r200Q8R281 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r200Q8R281 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r200Q8R281 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r200Q8R281 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r200Q8R281 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r200Q8R281 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r200Q8R281 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r200Q8R281 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r200Q8R281 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r200Q8R281 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r200Q8R281 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r200Q8R281 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r200Q8R281 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r200Q8R281 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r200Q8R281 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r200Q8R281 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r200Q8R281 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r200Q8R281 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r200Q8R281 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r200Q8R281 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r200Q8R281 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r200Q8R281 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r200Q8R281 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r200Q8R281 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r200Q8R281 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r200Q8R281 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r200Q8R281 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r200Q8R281 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vmn1r200Q8R281 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vmn1r200Q8R281 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vmn1r200Q8R281 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
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