Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ANKRD53Q8N9V6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ANKRD53Q8N9V6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ANKRD53Q8N9V6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ANKRD53Q8N9V6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ANKRD53Q8N9V6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ANKRD53Q8N9V6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ANKRD53Q8N9V6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ANKRD53Q8N9V6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ANKRD53Q8N9V6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ANKRD53Q8N9V6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD53Q8N9V6 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD53Q8N9V6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD53Q8N9V6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD53Q8N9V6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD53Q8N9V6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD53Q8N9V6 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD53Q8N9V6 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD53Q8N9V6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD53Q8N9V6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD53Q8N9V6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD53Q8N9V6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD53Q8N9V6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD53Q8N9V6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD53Q8N9V6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD53Q8N9V6 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD53Q8N9V6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD53Q8N9V6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD53Q8N9V6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD53Q8N9V6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD53Q8N9V6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD53Q8N9V6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD53Q8N9V6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD53Q8N9V6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD53Q8N9V6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD53Q8N9V6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD53Q8N9V6 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD53Q8N9V6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD53Q8N9V6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD53Q8N9V6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD53Q8N9V6 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD53Q8N9V6 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD53Q8N9V6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD53Q8N9V6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD53Q8N9V6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD53Q8N9V6 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD53Q8N9V6 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD53Q8N9V6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD53Q8N9V6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD53Q8N9V6 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD53Q8N9V6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD53Q8N9V6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD53Q8N9V6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD53Q8N9V6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ANKRD53Q8N9V6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ANKRD53Q8N9V6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ANKRD53Q8N9V6 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ANKRD53Q8N9V6 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ANKRD53Q8N9V6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ANKRD53Q8N9V6 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ANKRD53Q8N9V6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ANKRD53Q8N9V6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ANKRD53Q8N9V6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ANKRD53Q8N9V6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ANKRD53Q8N9V6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ANKRD53Q8N9V6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ANKRD53Q8N9V6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ANKRD53Q8N9V6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ANKRD53Q8N9V6 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ANKRD53Q8N9V6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ANKRD53Q8N9V6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ANKRD53Q8N9V6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ANKRD53Q8N9V6 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ANKRD53Q8N9V6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ANKRD53Q8N9V6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ANKRD53Q8N9V6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ANKRD53Q8N9V6 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ANKRD53Q8N9V6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ANKRD53Q8N9V6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ANKRD53Q8N9V6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ANKRD53Q8N9V6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ANKRD53Q8N9V6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms