Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2H2

Otud6b, OTU domain-containing protein 6B, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6bQ8K2H2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Otud6bQ8K2H2 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Otud6bQ8K2H2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Otud6bQ8K2H2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Otud6bQ8K2H2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Otud6bQ8K2H2 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Otud6bQ8K2H2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Otud6bQ8K2H2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Otud6bQ8K2H2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Otud6bQ8K2H2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Otud6bQ8K2H2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Otud6bQ8K2H2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Otud6bQ8K2H2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Otud6bQ8K2H2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Otud6bQ8K2H2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Otud6bQ8K2H2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Otud6bQ8K2H2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Otud6bQ8K2H2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Otud6bQ8K2H2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Otud6bQ8K2H2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Otud6bQ8K2H2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Otud6bQ8K2H2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Otud6bQ8K2H2 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Otud6bQ8K2H2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Otud6bQ8K2H2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Otud6bQ8K2H2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Otud6bQ8K2H2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Otud6bQ8K2H2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Otud6bQ8K2H2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Otud6bQ8K2H2 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Otud6bQ8K2H2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Otud6bQ8K2H2 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Otud6bQ8K2H2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Otud6bQ8K2H2 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Otud6bQ8K2H2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Otud6bQ8K2H2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Otud6bQ8K2H2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Otud6bQ8K2H2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Otud6bQ8K2H2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Otud6bQ8K2H2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Otud6bQ8K2H2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Otud6bQ8K2H2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Otud6bQ8K2H2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Otud6bQ8K2H2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Otud6bQ8K2H2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Otud6bQ8K2H2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Otud6bQ8K2H2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Otud6bQ8K2H2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Otud6bQ8K2H2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Otud6bQ8K2H2 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Otud6bQ8K2H2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Otud6bQ8K2H2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Otud6bQ8K2H2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Otud6bQ8K2H2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Otud6bQ8K2H2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Otud6bQ8K2H2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Otud6bQ8K2H2 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Otud6bQ8K2H2 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Otud6bQ8K2H2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Otud6bQ8K2H2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Otud6bQ8K2H2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Otud6bQ8K2H2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Otud6bQ8K2H2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Otud6bQ8K2H2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Otud6bQ8K2H2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Otud6bQ8K2H2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Otud6bQ8K2H2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Otud6bQ8K2H2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Otud6bQ8K2H2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Otud6bQ8K2H2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Otud6bQ8K2H2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Otud6bQ8K2H2 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Otud6bQ8K2H2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Otud6bQ8K2H2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Otud6bQ8K2H2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Otud6bQ8K2H2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Otud6bQ8K2H2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Otud6bQ8K2H2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Otud6bQ8K2H2 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Otud6bQ8K2H2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Otud6bQ8K2H2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Otud6bQ8K2H2 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Otud6bQ8K2H2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Otud6bQ8K2H2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Otud6bQ8K2H2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Otud6bQ8K2H2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Otud6bQ8K2H2 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Otud6bQ8K2H2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Otud6bQ8K2H2 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Otud6bQ8K2H2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Otud6bQ8K2H2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Otud6bQ8K2H2 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Otud6bQ8K2H2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Otud6bQ8K2H2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Otud6bQ8K2H2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Otud6bQ8K2H2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Otud6bQ8K2H2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Otud6bQ8K2H2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Otud6bQ8K2H2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Otud6bQ8K2H2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms