Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1E0

Stx5, Syntaxin-5, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx5Q8K1E0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stx5Q8K1E0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stx5Q8K1E0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stx5Q8K1E0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stx5Q8K1E0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stx5Q8K1E0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stx5Q8K1E0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stx5Q8K1E0 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stx5Q8K1E0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stx5Q8K1E0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stx5Q8K1E0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Stx5Q8K1E0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stx5Q8K1E0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stx5Q8K1E0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stx5Q8K1E0 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stx5Q8K1E0 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stx5Q8K1E0 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stx5Q8K1E0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stx5Q8K1E0 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stx5Q8K1E0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stx5Q8K1E0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stx5Q8K1E0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stx5Q8K1E0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stx5Q8K1E0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stx5Q8K1E0 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stx5Q8K1E0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stx5Q8K1E0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stx5Q8K1E0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stx5Q8K1E0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Stx5Q8K1E0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stx5Q8K1E0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stx5Q8K1E0 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stx5Q8K1E0 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stx5Q8K1E0 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stx5Q8K1E0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stx5Q8K1E0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stx5Q8K1E0 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stx5Q8K1E0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stx5Q8K1E0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stx5Q8K1E0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stx5Q8K1E0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stx5Q8K1E0 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stx5Q8K1E0 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stx5Q8K1E0 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stx5Q8K1E0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stx5Q8K1E0 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stx5Q8K1E0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stx5Q8K1E0 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stx5Q8K1E0 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stx5Q8K1E0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stx5Q8K1E0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stx5Q8K1E0 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stx5Q8K1E0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stx5Q8K1E0 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stx5Q8K1E0 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stx5Q8K1E0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stx5Q8K1E0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stx5Q8K1E0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stx5Q8K1E0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stx5Q8K1E0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stx5Q8K1E0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stx5Q8K1E0 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stx5Q8K1E0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stx5Q8K1E0 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stx5Q8K1E0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stx5Q8K1E0 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stx5Q8K1E0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stx5Q8K1E0 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stx5Q8K1E0 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stx5Q8K1E0 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stx5Q8K1E0 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stx5Q8K1E0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stx5Q8K1E0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stx5Q8K1E0 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stx5Q8K1E0 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stx5Q8K1E0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stx5Q8K1E0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Stx5Q8K1E0 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Stx5Q8K1E0 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Stx5Q8K1E0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Stx5Q8K1E0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stx5Q8K1E0 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stx5Q8K1E0 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stx5Q8K1E0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stx5Q8K1E0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stx5Q8K1E0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stx5Q8K1E0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stx5Q8K1E0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stx5Q8K1E0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stx5Q8K1E0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stx5Q8K1E0 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stx5Q8K1E0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx5Q8K1E0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx5Q8K1E0 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx5Q8K1E0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx5Q8K1E0 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx5Q8K1E0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx5Q8K1E0 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx5Q8K1E0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx5Q8K1E0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms