Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6E1

Apol7c, Apolipoprotein L 7c, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7cQ8C6E1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Apol7cQ8C6E1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Apol7cQ8C6E1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Apol7cQ8C6E1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Apol7cQ8C6E1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Apol7cQ8C6E1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Apol7cQ8C6E1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Apol7cQ8C6E1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Apol7cQ8C6E1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Apol7cQ8C6E1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Apol7cQ8C6E1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Apol7cQ8C6E1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Apol7cQ8C6E1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Apol7cQ8C6E1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Apol7cQ8C6E1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Apol7cQ8C6E1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Apol7cQ8C6E1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Apol7cQ8C6E1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Apol7cQ8C6E1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Apol7cQ8C6E1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Apol7cQ8C6E1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Apol7cQ8C6E1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Apol7cQ8C6E1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Apol7cQ8C6E1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Apol7cQ8C6E1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Apol7cQ8C6E1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Apol7cQ8C6E1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Apol7cQ8C6E1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Apol7cQ8C6E1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Apol7cQ8C6E1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Apol7cQ8C6E1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Apol7cQ8C6E1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Apol7cQ8C6E1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Apol7cQ8C6E1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Apol7cQ8C6E1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Apol7cQ8C6E1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Apol7cQ8C6E1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Apol7cQ8C6E1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Apol7cQ8C6E1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Apol7cQ8C6E1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Apol7cQ8C6E1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Apol7cQ8C6E1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Apol7cQ8C6E1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Apol7cQ8C6E1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Apol7cQ8C6E1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Apol7cQ8C6E1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Apol7cQ8C6E1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Apol7cQ8C6E1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Apol7cQ8C6E1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Apol7cQ8C6E1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Apol7cQ8C6E1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Apol7cQ8C6E1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Apol7cQ8C6E1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Apol7cQ8C6E1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Apol7cQ8C6E1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Apol7cQ8C6E1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Apol7cQ8C6E1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Apol7cQ8C6E1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Apol7cQ8C6E1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Apol7cQ8C6E1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Apol7cQ8C6E1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Apol7cQ8C6E1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Apol7cQ8C6E1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Apol7cQ8C6E1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Apol7cQ8C6E1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Apol7cQ8C6E1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Apol7cQ8C6E1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Apol7cQ8C6E1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Apol7cQ8C6E1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Apol7cQ8C6E1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Apol7cQ8C6E1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Apol7cQ8C6E1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Apol7cQ8C6E1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Apol7cQ8C6E1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Apol7cQ8C6E1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Apol7cQ8C6E1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Apol7cQ8C6E1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Apol7cQ8C6E1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Apol7cQ8C6E1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Apol7cQ8C6E1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Apol7cQ8C6E1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Apol7cQ8C6E1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Apol7cQ8C6E1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Apol7cQ8C6E1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Apol7cQ8C6E1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Apol7cQ8C6E1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Apol7cQ8C6E1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Apol7cQ8C6E1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Apol7cQ8C6E1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Apol7cQ8C6E1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Apol7cQ8C6E1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Apol7cQ8C6E1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Apol7cQ8C6E1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Apol7cQ8C6E1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Apol7cQ8C6E1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Apol7cQ8C6E1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Apol7cQ8C6E1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Apol7cQ8C6E1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Apol7cQ8C6E1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Apol7cQ8C6E1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms