Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYI9

Tnr, Tenascin-R, mousemouse

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnrQ8BYI9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TnrQ8BYI9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TnrQ8BYI9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TnrQ8BYI9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TnrQ8BYI9 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TnrQ8BYI9 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TnrQ8BYI9 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TnrQ8BYI9 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TnrQ8BYI9 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TnrQ8BYI9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TnrQ8BYI9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TnrQ8BYI9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TnrQ8BYI9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TnrQ8BYI9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TnrQ8BYI9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TnrQ8BYI9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TnrQ8BYI9 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TnrQ8BYI9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TnrQ8BYI9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TnrQ8BYI9 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TnrQ8BYI9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TnrQ8BYI9 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TnrQ8BYI9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TnrQ8BYI9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TnrQ8BYI9 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TnrQ8BYI9 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TnrQ8BYI9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TnrQ8BYI9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TnrQ8BYI9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TnrQ8BYI9 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TnrQ8BYI9 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TnrQ8BYI9 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TnrQ8BYI9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TnrQ8BYI9 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TnrQ8BYI9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TnrQ8BYI9 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TnrQ8BYI9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TnrQ8BYI9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TnrQ8BYI9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TnrQ8BYI9 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TnrQ8BYI9 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TnrQ8BYI9 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TnrQ8BYI9 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TnrQ8BYI9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TnrQ8BYI9 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TnrQ8BYI9 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TnrQ8BYI9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TnrQ8BYI9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TnrQ8BYI9 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TnrQ8BYI9 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TnrQ8BYI9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TnrQ8BYI9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TnrQ8BYI9 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TnrQ8BYI9 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TnrQ8BYI9 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TnrQ8BYI9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TnrQ8BYI9 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TnrQ8BYI9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TnrQ8BYI9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TnrQ8BYI9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TnrQ8BYI9 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TnrQ8BYI9 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TnrQ8BYI9 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TnrQ8BYI9 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TnrQ8BYI9 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TnrQ8BYI9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TnrQ8BYI9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TnrQ8BYI9 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TnrQ8BYI9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TnrQ8BYI9 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TnrQ8BYI9 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TnrQ8BYI9 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TnrQ8BYI9 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TnrQ8BYI9 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TnrQ8BYI9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TnrQ8BYI9 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TnrQ8BYI9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TnrQ8BYI9 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TnrQ8BYI9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TnrQ8BYI9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TnrQ8BYI9 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TnrQ8BYI9 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TnrQ8BYI9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TnrQ8BYI9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TnrQ8BYI9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TnrQ8BYI9 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TnrQ8BYI9 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TnrQ8BYI9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TnrQ8BYI9 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TnrQ8BYI9 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TnrQ8BYI9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TnrQ8BYI9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TnrQ8BYI9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TnrQ8BYI9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TnrQ8BYI9 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TnrQ8BYI9 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TnrQ8BYI9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TnrQ8BYI9 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TnrQ8BYI9 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TnrQ8BYI9 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms