Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubash3bQ8BGG7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubash3bQ8BGG7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubash3bQ8BGG7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubash3bQ8BGG7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubash3bQ8BGG7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubash3bQ8BGG7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubash3bQ8BGG7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubash3bQ8BGG7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubash3bQ8BGG7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubash3bQ8BGG7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubash3bQ8BGG7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ubash3bQ8BGG7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ubash3bQ8BGG7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ubash3bQ8BGG7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ubash3bQ8BGG7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ubash3bQ8BGG7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ubash3bQ8BGG7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ubash3bQ8BGG7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ubash3bQ8BGG7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ubash3bQ8BGG7 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ubash3bQ8BGG7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ubash3bQ8BGG7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ubash3bQ8BGG7 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ubash3bQ8BGG7 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ubash3bQ8BGG7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ubash3bQ8BGG7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ubash3bQ8BGG7 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ubash3bQ8BGG7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ubash3bQ8BGG7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ubash3bQ8BGG7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ubash3bQ8BGG7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ubash3bQ8BGG7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ubash3bQ8BGG7 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ubash3bQ8BGG7 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ubash3bQ8BGG7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ubash3bQ8BGG7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ubash3bQ8BGG7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ubash3bQ8BGG7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ubash3bQ8BGG7 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ubash3bQ8BGG7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ubash3bQ8BGG7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ubash3bQ8BGG7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ubash3bQ8BGG7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ubash3bQ8BGG7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ubash3bQ8BGG7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ubash3bQ8BGG7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ubash3bQ8BGG7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ubash3bQ8BGG7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ubash3bQ8BGG7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ubash3bQ8BGG7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ubash3bQ8BGG7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ubash3bQ8BGG7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ubash3bQ8BGG7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ubash3bQ8BGG7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ubash3bQ8BGG7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ubash3bQ8BGG7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ubash3bQ8BGG7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ubash3bQ8BGG7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ubash3bQ8BGG7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ubash3bQ8BGG7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ubash3bQ8BGG7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ubash3bQ8BGG7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ubash3bQ8BGG7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ubash3bQ8BGG7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ubash3bQ8BGG7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ubash3bQ8BGG7 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ubash3bQ8BGG7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ubash3bQ8BGG7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ubash3bQ8BGG7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ubash3bQ8BGG7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ubash3bQ8BGG7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ubash3bQ8BGG7 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ubash3bQ8BGG7 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ubash3bQ8BGG7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubash3bQ8BGG7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubash3bQ8BGG7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubash3bQ8BGG7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubash3bQ8BGG7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubash3bQ8BGG7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubash3bQ8BGG7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubash3bQ8BGG7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubash3bQ8BGG7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubash3bQ8BGG7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubash3bQ8BGG7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubash3bQ8BGG7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubash3bQ8BGG7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubash3bQ8BGG7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubash3bQ8BGG7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubash3bQ8BGG7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubash3bQ8BGG7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubash3bQ8BGG7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubash3bQ8BGG7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubash3bQ8BGG7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubash3bQ8BGG7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubash3bQ8BGG7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubash3bQ8BGG7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubash3bQ8BGG7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubash3bQ8BGG7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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