Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG40

Katnb1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katnb1Q8BG40 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Katnb1Q8BG40 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Katnb1Q8BG40 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Katnb1Q8BG40 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Katnb1Q8BG40 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Katnb1Q8BG40 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Katnb1Q8BG40 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Katnb1Q8BG40 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Katnb1Q8BG40 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Katnb1Q8BG40 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Katnb1Q8BG40 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Katnb1Q8BG40 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Katnb1Q8BG40 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Katnb1Q8BG40 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Katnb1Q8BG40 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Katnb1Q8BG40 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Katnb1Q8BG40 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Katnb1Q8BG40 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Katnb1Q8BG40 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Katnb1Q8BG40 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Katnb1Q8BG40 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Katnb1Q8BG40 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Katnb1Q8BG40 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Katnb1Q8BG40 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Katnb1Q8BG40 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Katnb1Q8BG40 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Katnb1Q8BG40 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Katnb1Q8BG40 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Katnb1Q8BG40 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Katnb1Q8BG40 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Katnb1Q8BG40 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Katnb1Q8BG40 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Katnb1Q8BG40 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Katnb1Q8BG40 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Katnb1Q8BG40 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Katnb1Q8BG40 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Katnb1Q8BG40 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Katnb1Q8BG40 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Katnb1Q8BG40 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Katnb1Q8BG40 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Katnb1Q8BG40 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Katnb1Q8BG40 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Katnb1Q8BG40 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Katnb1Q8BG40 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Katnb1Q8BG40 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Katnb1Q8BG40 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Katnb1Q8BG40 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Katnb1Q8BG40 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Katnb1Q8BG40 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Katnb1Q8BG40 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Katnb1Q8BG40 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Katnb1Q8BG40 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Katnb1Q8BG40 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Katnb1Q8BG40 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Katnb1Q8BG40 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Katnb1Q8BG40 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Katnb1Q8BG40 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Katnb1Q8BG40 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Katnb1Q8BG40 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Katnb1Q8BG40 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Katnb1Q8BG40 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Katnb1Q8BG40 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Katnb1Q8BG40 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Katnb1Q8BG40 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Katnb1Q8BG40 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Katnb1Q8BG40 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Katnb1Q8BG40 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Katnb1Q8BG40 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Katnb1Q8BG40 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Katnb1Q8BG40 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Katnb1Q8BG40 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Katnb1Q8BG40 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Katnb1Q8BG40 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Katnb1Q8BG40 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Katnb1Q8BG40 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Katnb1Q8BG40 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Katnb1Q8BG40 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Katnb1Q8BG40 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Katnb1Q8BG40 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Katnb1Q8BG40 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Katnb1Q8BG40 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Katnb1Q8BG40 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Katnb1Q8BG40 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Katnb1Q8BG40 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Katnb1Q8BG40 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Katnb1Q8BG40 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Katnb1Q8BG40 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Katnb1Q8BG40 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Katnb1Q8BG40 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Katnb1Q8BG40 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Katnb1Q8BG40 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Katnb1Q8BG40 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Katnb1Q8BG40 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Katnb1Q8BG40 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Katnb1Q8BG40 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Katnb1Q8BG40 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Katnb1Q8BG40 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Katnb1Q8BG40 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Katnb1Q8BG40 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Katnb1Q8BG40 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms