Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z739

YTHDF3, YTH domain-containing family protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF3Q7Z739 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
YTHDF3Q7Z739 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
YTHDF3Q7Z739 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
YTHDF3Q7Z739 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
YTHDF3Q7Z739 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
YTHDF3Q7Z739 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
YTHDF3Q7Z739 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
YTHDF3Q7Z739 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
YTHDF3Q7Z739 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
YTHDF3Q7Z739 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
YTHDF3Q7Z739 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
YTHDF3Q7Z739 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
YTHDF3Q7Z739 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
YTHDF3Q7Z739 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
YTHDF3Q7Z739 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
YTHDF3Q7Z739 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
YTHDF3Q7Z739 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
YTHDF3Q7Z739 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
YTHDF3Q7Z739 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
YTHDF3Q7Z739 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
YTHDF3Q7Z739 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
YTHDF3Q7Z739 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
YTHDF3Q7Z739 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
YTHDF3Q7Z739 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
YTHDF3Q7Z739 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
YTHDF3Q7Z739 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
YTHDF3Q7Z739 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
YTHDF3Q7Z739 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
YTHDF3Q7Z739 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
YTHDF3Q7Z739 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
YTHDF3Q7Z739 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
YTHDF3Q7Z739 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
YTHDF3Q7Z739 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
YTHDF3Q7Z739 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
YTHDF3Q7Z739 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
YTHDF3Q7Z739 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
YTHDF3Q7Z739 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
YTHDF3Q7Z739 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
YTHDF3Q7Z739 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
YTHDF3Q7Z739 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
YTHDF3Q7Z739 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
YTHDF3Q7Z739 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
YTHDF3Q7Z739 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
YTHDF3Q7Z739 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
YTHDF3Q7Z739 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
YTHDF3Q7Z739 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
YTHDF3Q7Z739 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
YTHDF3Q7Z739 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
YTHDF3Q7Z739 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
YTHDF3Q7Z739 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
YTHDF3Q7Z739 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
YTHDF3Q7Z739 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
YTHDF3Q7Z739 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
YTHDF3Q7Z739 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
YTHDF3Q7Z739 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
YTHDF3Q7Z739 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
YTHDF3Q7Z739 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
YTHDF3Q7Z739 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
YTHDF3Q7Z739 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
YTHDF3Q7Z739 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
YTHDF3Q7Z739 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
YTHDF3Q7Z739 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
YTHDF3Q7Z739 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
YTHDF3Q7Z739 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
YTHDF3Q7Z739 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
YTHDF3Q7Z739 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
YTHDF3Q7Z739 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
YTHDF3Q7Z739 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
YTHDF3Q7Z739 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
YTHDF3Q7Z739 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
YTHDF3Q7Z739 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
YTHDF3Q7Z739 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
YTHDF3Q7Z739 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
YTHDF3Q7Z739 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
YTHDF3Q7Z739 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
YTHDF3Q7Z739 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
YTHDF3Q7Z739 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
YTHDF3Q7Z739 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
YTHDF3Q7Z739 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
YTHDF3Q7Z739 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
YTHDF3Q7Z739 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
YTHDF3Q7Z739 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
YTHDF3Q7Z739 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
YTHDF3Q7Z739 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
YTHDF3Q7Z739 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
YTHDF3Q7Z739 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
YTHDF3Q7Z739 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
YTHDF3Q7Z739 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
YTHDF3Q7Z739 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
YTHDF3Q7Z739 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
YTHDF3Q7Z739 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
YTHDF3Q7Z739 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
YTHDF3Q7Z739 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
YTHDF3Q7Z739 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
YTHDF3Q7Z739 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
YTHDF3Q7Z739 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
YTHDF3Q7Z739 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
YTHDF3Q7Z739 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
YTHDF3Q7Z739 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
YTHDF3Q7Z739 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms