Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clec18aQ7TSQ1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Clec18aQ7TSQ1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clec18aQ7TSQ1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clec18aQ7TSQ1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clec18aQ7TSQ1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Clec18aQ7TSQ1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clec18aQ7TSQ1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Clec18aQ7TSQ1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clec18aQ7TSQ1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clec18aQ7TSQ1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clec18aQ7TSQ1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clec18aQ7TSQ1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clec18aQ7TSQ1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clec18aQ7TSQ1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clec18aQ7TSQ1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clec18aQ7TSQ1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clec18aQ7TSQ1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clec18aQ7TSQ1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clec18aQ7TSQ1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clec18aQ7TSQ1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clec18aQ7TSQ1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clec18aQ7TSQ1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Clec18aQ7TSQ1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clec18aQ7TSQ1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clec18aQ7TSQ1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clec18aQ7TSQ1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Clec18aQ7TSQ1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Clec18aQ7TSQ1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Clec18aQ7TSQ1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Clec18aQ7TSQ1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Clec18aQ7TSQ1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Clec18aQ7TSQ1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Clec18aQ7TSQ1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Clec18aQ7TSQ1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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Clec18aQ7TSQ1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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Clec18aQ7TSQ1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Clec18aQ7TSQ1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Clec18aQ7TSQ1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Clec18aQ7TSQ1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Clec18aQ7TSQ1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Clec18aQ7TSQ1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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Clec18aQ7TSQ1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Clec18aQ7TSQ1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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Clec18aQ7TSQ1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Clec18aQ7TSQ1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Clec18aQ7TSQ1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Clec18aQ7TSQ1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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Clec18aQ7TSQ1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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Clec18aQ7TSQ1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Clec18aQ7TSQ1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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Clec18aQ7TSQ1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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Clec18aQ7TSQ1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
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Clec18aQ7TSQ1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Clec18aQ7TSQ1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Clec18aQ7TSQ1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Clec18aQ7TSQ1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Clec18aQ7TSQ1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Clec18aQ7TSQ1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Clec18aQ7TSQ1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Clec18aQ7TSQ1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Clec18aQ7TSQ1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Clec18aQ7TSQ1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Clec18aQ7TSQ1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Clec18aQ7TSQ1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Clec18aQ7TSQ1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Clec18aQ7TSQ1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Clec18aQ7TSQ1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Clec18aQ7TSQ1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Clec18aQ7TSQ1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clec18aQ7TSQ1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clec18aQ7TSQ1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clec18aQ7TSQ1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clec18aQ7TSQ1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Clec18aQ7TSQ1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clec18aQ7TSQ1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clec18aQ7TSQ1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clec18aQ7TSQ1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clec18aQ7TSQ1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clec18aQ7TSQ1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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