Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dsg1cQ7TSF0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dsg1cQ7TSF0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dsg1cQ7TSF0 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dsg1cQ7TSF0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dsg1cQ7TSF0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dsg1cQ7TSF0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Dsg1cQ7TSF0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dsg1cQ7TSF0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dsg1cQ7TSF0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dsg1cQ7TSF0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dsg1cQ7TSF0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dsg1cQ7TSF0 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dsg1cQ7TSF0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dsg1cQ7TSF0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dsg1cQ7TSF0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Dsg1cQ7TSF0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dsg1cQ7TSF0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Dsg1cQ7TSF0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Dsg1cQ7TSF0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dsg1cQ7TSF0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dsg1cQ7TSF0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dsg1cQ7TSF0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dsg1cQ7TSF0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Dsg1cQ7TSF0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dsg1cQ7TSF0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dsg1cQ7TSF0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dsg1cQ7TSF0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dsg1cQ7TSF0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dsg1cQ7TSF0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dsg1cQ7TSF0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Dsg1cQ7TSF0 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dsg1cQ7TSF0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dsg1cQ7TSF0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dsg1cQ7TSF0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dsg1cQ7TSF0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dsg1cQ7TSF0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dsg1cQ7TSF0 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dsg1cQ7TSF0 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dsg1cQ7TSF0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dsg1cQ7TSF0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dsg1cQ7TSF0 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dsg1cQ7TSF0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dsg1cQ7TSF0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dsg1cQ7TSF0 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dsg1cQ7TSF0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dsg1cQ7TSF0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dsg1cQ7TSF0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dsg1cQ7TSF0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dsg1cQ7TSF0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Dsg1cQ7TSF0 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dsg1cQ7TSF0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dsg1cQ7TSF0 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dsg1cQ7TSF0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dsg1cQ7TSF0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dsg1cQ7TSF0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dsg1cQ7TSF0 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dsg1cQ7TSF0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dsg1cQ7TSF0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dsg1cQ7TSF0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dsg1cQ7TSF0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dsg1cQ7TSF0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dsg1cQ7TSF0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dsg1cQ7TSF0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dsg1cQ7TSF0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dsg1cQ7TSF0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dsg1cQ7TSF0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dsg1cQ7TSF0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dsg1cQ7TSF0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dsg1cQ7TSF0 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dsg1cQ7TSF0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dsg1cQ7TSF0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dsg1cQ7TSF0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Dsg1cQ7TSF0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dsg1cQ7TSF0 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dsg1cQ7TSF0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dsg1cQ7TSF0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dsg1cQ7TSF0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Dsg1cQ7TSF0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dsg1cQ7TSF0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dsg1cQ7TSF0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dsg1cQ7TSF0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dsg1cQ7TSF0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dsg1cQ7TSF0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dsg1cQ7TSF0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dsg1cQ7TSF0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dsg1cQ7TSF0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dsg1cQ7TSF0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dsg1cQ7TSF0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Dsg1cQ7TSF0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dsg1cQ7TSF0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dsg1cQ7TSF0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dsg1cQ7TSF0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dsg1cQ7TSF0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dsg1cQ7TSF0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dsg1cQ7TSF0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dsg1cQ7TSF0 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dsg1cQ7TSF0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dsg1cQ7TSF0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dsg1cQ7TSF0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms