Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sys1Q78S06 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sys1Q78S06 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sys1Q78S06 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sys1Q78S06 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sys1Q78S06 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sys1Q78S06 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sys1Q78S06 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sys1Q78S06 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sys1Q78S06 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sys1Q78S06 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sys1Q78S06 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sys1Q78S06 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sys1Q78S06 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sys1Q78S06 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sys1Q78S06 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sys1Q78S06 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sys1Q78S06 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sys1Q78S06 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sys1Q78S06 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sys1Q78S06 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sys1Q78S06 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sys1Q78S06 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sys1Q78S06 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sys1Q78S06 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sys1Q78S06 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sys1Q78S06 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sys1Q78S06 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sys1Q78S06 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sys1Q78S06 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sys1Q78S06 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sys1Q78S06 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sys1Q78S06 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sys1Q78S06 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sys1Q78S06 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sys1Q78S06 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sys1Q78S06 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sys1Q78S06 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sys1Q78S06 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sys1Q78S06 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sys1Q78S06 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sys1Q78S06 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sys1Q78S06 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sys1Q78S06 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sys1Q78S06 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sys1Q78S06 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sys1Q78S06 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sys1Q78S06 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sys1Q78S06 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sys1Q78S06 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sys1Q78S06 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sys1Q78S06 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sys1Q78S06 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sys1Q78S06 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sys1Q78S06 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sys1Q78S06 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sys1Q78S06 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sys1Q78S06 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sys1Q78S06 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sys1Q78S06 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sys1Q78S06 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sys1Q78S06 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sys1Q78S06 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sys1Q78S06 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sys1Q78S06 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sys1Q78S06 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sys1Q78S06 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sys1Q78S06 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sys1Q78S06 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sys1Q78S06 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sys1Q78S06 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sys1Q78S06 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sys1Q78S06 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sys1Q78S06 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sys1Q78S06 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sys1Q78S06 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sys1Q78S06 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sys1Q78S06 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sys1Q78S06 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sys1Q78S06 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sys1Q78S06 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sys1Q78S06 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sys1Q78S06 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sys1Q78S06 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sys1Q78S06 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sys1Q78S06 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sys1Q78S06 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sys1Q78S06 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sys1Q78S06 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sys1Q78S06 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sys1Q78S06 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sys1Q78S06 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sys1Q78S06 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sys1Q78S06 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sys1Q78S06 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sys1Q78S06 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sys1Q78S06 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sys1Q78S06 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sys1Q78S06 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sys1Q78S06 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms