Protein–RNA interactions for Protein: Q6VZZ7

Opn5, Opsin-5, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn5Q6VZZ7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Opn5Q6VZZ7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Opn5Q6VZZ7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Opn5Q6VZZ7 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Opn5Q6VZZ7 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Opn5Q6VZZ7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Opn5Q6VZZ7 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Opn5Q6VZZ7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Opn5Q6VZZ7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Opn5Q6VZZ7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Opn5Q6VZZ7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Opn5Q6VZZ7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Opn5Q6VZZ7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Opn5Q6VZZ7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Opn5Q6VZZ7 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Opn5Q6VZZ7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Opn5Q6VZZ7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Opn5Q6VZZ7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Opn5Q6VZZ7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Opn5Q6VZZ7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Opn5Q6VZZ7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Opn5Q6VZZ7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Opn5Q6VZZ7 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Opn5Q6VZZ7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Opn5Q6VZZ7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Opn5Q6VZZ7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Opn5Q6VZZ7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Opn5Q6VZZ7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Opn5Q6VZZ7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Opn5Q6VZZ7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Opn5Q6VZZ7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Opn5Q6VZZ7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Opn5Q6VZZ7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Opn5Q6VZZ7 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Opn5Q6VZZ7 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Opn5Q6VZZ7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Opn5Q6VZZ7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Opn5Q6VZZ7 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Opn5Q6VZZ7 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Opn5Q6VZZ7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Opn5Q6VZZ7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Opn5Q6VZZ7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Opn5Q6VZZ7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Opn5Q6VZZ7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Opn5Q6VZZ7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Opn5Q6VZZ7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Opn5Q6VZZ7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Opn5Q6VZZ7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Opn5Q6VZZ7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Opn5Q6VZZ7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Opn5Q6VZZ7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Opn5Q6VZZ7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Opn5Q6VZZ7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Opn5Q6VZZ7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Opn5Q6VZZ7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Opn5Q6VZZ7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Opn5Q6VZZ7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Opn5Q6VZZ7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Opn5Q6VZZ7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Opn5Q6VZZ7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Opn5Q6VZZ7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Opn5Q6VZZ7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Opn5Q6VZZ7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Opn5Q6VZZ7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Opn5Q6VZZ7 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Opn5Q6VZZ7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Opn5Q6VZZ7 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Opn5Q6VZZ7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Opn5Q6VZZ7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Opn5Q6VZZ7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Opn5Q6VZZ7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Opn5Q6VZZ7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Opn5Q6VZZ7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Opn5Q6VZZ7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Opn5Q6VZZ7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Opn5Q6VZZ7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Opn5Q6VZZ7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Opn5Q6VZZ7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Opn5Q6VZZ7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Opn5Q6VZZ7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Opn5Q6VZZ7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Opn5Q6VZZ7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Opn5Q6VZZ7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Opn5Q6VZZ7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Opn5Q6VZZ7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Opn5Q6VZZ7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Opn5Q6VZZ7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Opn5Q6VZZ7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Opn5Q6VZZ7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Opn5Q6VZZ7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Opn5Q6VZZ7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Opn5Q6VZZ7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Opn5Q6VZZ7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Opn5Q6VZZ7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Opn5Q6VZZ7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Opn5Q6VZZ7 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Opn5Q6VZZ7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Opn5Q6VZZ7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Opn5Q6VZZ7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Opn5Q6VZZ7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.4 ms