Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NANOGP8Q6NSW7 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NANOGP8Q6NSW7 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NANOGP8Q6NSW7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NANOGP8Q6NSW7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NANOGP8Q6NSW7 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NANOGP8Q6NSW7 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NANOGP8Q6NSW7 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NANOGP8Q6NSW7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NANOGP8Q6NSW7 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NANOGP8Q6NSW7 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NANOGP8Q6NSW7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NANOGP8Q6NSW7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NANOGP8Q6NSW7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NANOGP8Q6NSW7 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NANOGP8Q6NSW7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NANOGP8Q6NSW7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NANOGP8Q6NSW7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NANOGP8Q6NSW7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NANOGP8Q6NSW7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NANOGP8Q6NSW7 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NANOGP8Q6NSW7 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NANOGP8Q6NSW7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NANOGP8Q6NSW7 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NANOGP8Q6NSW7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NANOGP8Q6NSW7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NANOGP8Q6NSW7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NANOGP8Q6NSW7 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NANOGP8Q6NSW7 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NANOGP8Q6NSW7 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NANOGP8Q6NSW7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NANOGP8Q6NSW7 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NANOGP8Q6NSW7 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NANOGP8Q6NSW7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NANOGP8Q6NSW7 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NANOGP8Q6NSW7 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NANOGP8Q6NSW7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NANOGP8Q6NSW7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NANOGP8Q6NSW7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NANOGP8Q6NSW7 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NANOGP8Q6NSW7 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NANOGP8Q6NSW7 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NANOGP8Q6NSW7 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NANOGP8Q6NSW7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NANOGP8Q6NSW7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NANOGP8Q6NSW7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NANOGP8Q6NSW7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NANOGP8Q6NSW7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NANOGP8Q6NSW7 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NANOGP8Q6NSW7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NANOGP8Q6NSW7 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NANOGP8Q6NSW7 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NANOGP8Q6NSW7 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NANOGP8Q6NSW7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NANOGP8Q6NSW7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NANOGP8Q6NSW7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NANOGP8Q6NSW7 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NANOGP8Q6NSW7 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NANOGP8Q6NSW7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NANOGP8Q6NSW7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NANOGP8Q6NSW7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NANOGP8Q6NSW7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NANOGP8Q6NSW7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NANOGP8Q6NSW7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NANOGP8Q6NSW7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NANOGP8Q6NSW7 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NANOGP8Q6NSW7 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NANOGP8Q6NSW7 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NANOGP8Q6NSW7 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NANOGP8Q6NSW7 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NANOGP8Q6NSW7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NANOGP8Q6NSW7 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NANOGP8Q6NSW7 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NANOGP8Q6NSW7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NANOGP8Q6NSW7 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NANOGP8Q6NSW7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NANOGP8Q6NSW7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NANOGP8Q6NSW7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NANOGP8Q6NSW7 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NANOGP8Q6NSW7 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NANOGP8Q6NSW7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NANOGP8Q6NSW7 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NANOGP8Q6NSW7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NANOGP8Q6NSW7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NANOGP8Q6NSW7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NANOGP8Q6NSW7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NANOGP8Q6NSW7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NANOGP8Q6NSW7 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NANOGP8Q6NSW7 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NANOGP8Q6NSW7 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NANOGP8Q6NSW7 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NANOGP8Q6NSW7 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NANOGP8Q6NSW7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NANOGP8Q6NSW7 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NANOGP8Q6NSW7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NANOGP8Q6NSW7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NANOGP8Q6NSW7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NANOGP8Q6NSW7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NANOGP8Q6NSW7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NANOGP8Q6NSW7 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms