Protein–RNA interactions for Protein: Q66K08

Cilp, Cartilage intermediate layer protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CilpQ66K08 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CilpQ66K08 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CilpQ66K08 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CilpQ66K08 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CilpQ66K08 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CilpQ66K08 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CilpQ66K08 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CilpQ66K08 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CilpQ66K08 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CilpQ66K08 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CilpQ66K08 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CilpQ66K08 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CilpQ66K08 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CilpQ66K08 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CilpQ66K08 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CilpQ66K08 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CilpQ66K08 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CilpQ66K08 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CilpQ66K08 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CilpQ66K08 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CilpQ66K08 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CilpQ66K08 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CilpQ66K08 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CilpQ66K08 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CilpQ66K08 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CilpQ66K08 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CilpQ66K08 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CilpQ66K08 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CilpQ66K08 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CilpQ66K08 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CilpQ66K08 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CilpQ66K08 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CilpQ66K08 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CilpQ66K08 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CilpQ66K08 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CilpQ66K08 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CilpQ66K08 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CilpQ66K08 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CilpQ66K08 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CilpQ66K08 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CilpQ66K08 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CilpQ66K08 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CilpQ66K08 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CilpQ66K08 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CilpQ66K08 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CilpQ66K08 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CilpQ66K08 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CilpQ66K08 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CilpQ66K08 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CilpQ66K08 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CilpQ66K08 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CilpQ66K08 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CilpQ66K08 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CilpQ66K08 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CilpQ66K08 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CilpQ66K08 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CilpQ66K08 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CilpQ66K08 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CilpQ66K08 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CilpQ66K08 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CilpQ66K08 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CilpQ66K08 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CilpQ66K08 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CilpQ66K08 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CilpQ66K08 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CilpQ66K08 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CilpQ66K08 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CilpQ66K08 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CilpQ66K08 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CilpQ66K08 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CilpQ66K08 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CilpQ66K08 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CilpQ66K08 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CilpQ66K08 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CilpQ66K08 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CilpQ66K08 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CilpQ66K08 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CilpQ66K08 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CilpQ66K08 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CilpQ66K08 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CilpQ66K08 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CilpQ66K08 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CilpQ66K08 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CilpQ66K08 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CilpQ66K08 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CilpQ66K08 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CilpQ66K08 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CilpQ66K08 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CilpQ66K08 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CilpQ66K08 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CilpQ66K08 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CilpQ66K08 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CilpQ66K08 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CilpQ66K08 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CilpQ66K08 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CilpQ66K08 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CilpQ66K08 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CilpQ66K08 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CilpQ66K08 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CilpQ66K08 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms