Protein–RNA interactions for Protein: Q61412

Vsx2, Visual system homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx2Q61412 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vsx2Q61412 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vsx2Q61412 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vsx2Q61412 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vsx2Q61412 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vsx2Q61412 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vsx2Q61412 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Vsx2Q61412 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vsx2Q61412 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vsx2Q61412 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vsx2Q61412 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vsx2Q61412 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vsx2Q61412 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vsx2Q61412 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vsx2Q61412 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vsx2Q61412 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Vsx2Q61412 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vsx2Q61412 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vsx2Q61412 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vsx2Q61412 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vsx2Q61412 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Vsx2Q61412 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vsx2Q61412 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vsx2Q61412 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vsx2Q61412 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vsx2Q61412 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Vsx2Q61412 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vsx2Q61412 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vsx2Q61412 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vsx2Q61412 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vsx2Q61412 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vsx2Q61412 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vsx2Q61412 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vsx2Q61412 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vsx2Q61412 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vsx2Q61412 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vsx2Q61412 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vsx2Q61412 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vsx2Q61412 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vsx2Q61412 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Vsx2Q61412 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vsx2Q61412 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vsx2Q61412 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vsx2Q61412 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vsx2Q61412 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vsx2Q61412 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vsx2Q61412 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vsx2Q61412 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Vsx2Q61412 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vsx2Q61412 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vsx2Q61412 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vsx2Q61412 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vsx2Q61412 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vsx2Q61412 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vsx2Q61412 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vsx2Q61412 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vsx2Q61412 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vsx2Q61412 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vsx2Q61412 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vsx2Q61412 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Vsx2Q61412 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vsx2Q61412 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vsx2Q61412 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vsx2Q61412 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vsx2Q61412 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vsx2Q61412 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vsx2Q61412 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vsx2Q61412 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vsx2Q61412 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vsx2Q61412 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vsx2Q61412 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vsx2Q61412 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vsx2Q61412 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vsx2Q61412 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vsx2Q61412 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vsx2Q61412 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vsx2Q61412 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vsx2Q61412 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vsx2Q61412 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Vsx2Q61412 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vsx2Q61412 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Vsx2Q61412 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vsx2Q61412 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vsx2Q61412 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vsx2Q61412 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vsx2Q61412 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vsx2Q61412 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vsx2Q61412 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vsx2Q61412 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vsx2Q61412 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vsx2Q61412 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vsx2Q61412 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vsx2Q61412 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Vsx2Q61412 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vsx2Q61412 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vsx2Q61412 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vsx2Q61412 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vsx2Q61412 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vsx2Q61412 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vsx2Q61412 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms