Protein–RNA interactions for Protein: Q61233

Lcp1, Plastin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcp1Q61233 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lcp1Q61233 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Lcp1Q61233 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lcp1Q61233 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lcp1Q61233 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lcp1Q61233 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lcp1Q61233 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lcp1Q61233 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lcp1Q61233 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lcp1Q61233 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lcp1Q61233 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lcp1Q61233 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lcp1Q61233 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lcp1Q61233 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lcp1Q61233 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lcp1Q61233 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lcp1Q61233 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lcp1Q61233 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lcp1Q61233 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lcp1Q61233 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lcp1Q61233 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lcp1Q61233 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lcp1Q61233 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lcp1Q61233 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lcp1Q61233 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lcp1Q61233 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lcp1Q61233 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lcp1Q61233 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lcp1Q61233 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lcp1Q61233 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lcp1Q61233 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lcp1Q61233 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lcp1Q61233 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lcp1Q61233 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lcp1Q61233 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lcp1Q61233 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lcp1Q61233 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lcp1Q61233 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lcp1Q61233 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lcp1Q61233 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lcp1Q61233 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lcp1Q61233 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lcp1Q61233 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lcp1Q61233 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lcp1Q61233 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lcp1Q61233 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lcp1Q61233 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lcp1Q61233 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lcp1Q61233 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lcp1Q61233 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lcp1Q61233 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lcp1Q61233 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lcp1Q61233 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lcp1Q61233 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lcp1Q61233 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Lcp1Q61233 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lcp1Q61233 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lcp1Q61233 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lcp1Q61233 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lcp1Q61233 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lcp1Q61233 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lcp1Q61233 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lcp1Q61233 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lcp1Q61233 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lcp1Q61233 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lcp1Q61233 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lcp1Q61233 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lcp1Q61233 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lcp1Q61233 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lcp1Q61233 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Lcp1Q61233 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lcp1Q61233 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lcp1Q61233 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lcp1Q61233 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lcp1Q61233 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lcp1Q61233 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lcp1Q61233 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lcp1Q61233 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lcp1Q61233 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lcp1Q61233 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lcp1Q61233 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lcp1Q61233 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lcp1Q61233 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lcp1Q61233 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lcp1Q61233 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lcp1Q61233 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lcp1Q61233 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lcp1Q61233 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lcp1Q61233 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lcp1Q61233 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lcp1Q61233 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lcp1Q61233 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lcp1Q61233 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lcp1Q61233 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lcp1Q61233 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lcp1Q61233 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lcp1Q61233 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lcp1Q61233 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lcp1Q61233 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lcp1Q61233 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms