Protein–RNA interactions for Protein: Q61179

Irf9, Interferon regulatory factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf9Q61179 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Irf9Q61179 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Irf9Q61179 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Irf9Q61179 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Irf9Q61179 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Irf9Q61179 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Irf9Q61179 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Irf9Q61179 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Irf9Q61179 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Irf9Q61179 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Irf9Q61179 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Irf9Q61179 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Irf9Q61179 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Irf9Q61179 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Irf9Q61179 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Irf9Q61179 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Irf9Q61179 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Irf9Q61179 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Irf9Q61179 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Irf9Q61179 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Irf9Q61179 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Irf9Q61179 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Irf9Q61179 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Irf9Q61179 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Irf9Q61179 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Irf9Q61179 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Irf9Q61179 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Irf9Q61179 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Irf9Q61179 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Irf9Q61179 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Irf9Q61179 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Irf9Q61179 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Irf9Q61179 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Irf9Q61179 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Irf9Q61179 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Irf9Q61179 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Irf9Q61179 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Irf9Q61179 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Irf9Q61179 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Irf9Q61179 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Irf9Q61179 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Irf9Q61179 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Irf9Q61179 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Irf9Q61179 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Irf9Q61179 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Irf9Q61179 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Irf9Q61179 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Irf9Q61179 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Irf9Q61179 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Irf9Q61179 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Irf9Q61179 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Irf9Q61179 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Irf9Q61179 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Irf9Q61179 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Irf9Q61179 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Irf9Q61179 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Irf9Q61179 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Irf9Q61179 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Irf9Q61179 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Irf9Q61179 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Irf9Q61179 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Irf9Q61179 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Irf9Q61179 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Irf9Q61179 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Irf9Q61179 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Irf9Q61179 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Irf9Q61179 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Irf9Q61179 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Irf9Q61179 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Irf9Q61179 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Irf9Q61179 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Irf9Q61179 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Irf9Q61179 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Irf9Q61179 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Irf9Q61179 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Irf9Q61179 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Irf9Q61179 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Irf9Q61179 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Irf9Q61179 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Irf9Q61179 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Irf9Q61179 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Irf9Q61179 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Irf9Q61179 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Irf9Q61179 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Irf9Q61179 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Irf9Q61179 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Irf9Q61179 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Irf9Q61179 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Irf9Q61179 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Irf9Q61179 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Irf9Q61179 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Irf9Q61179 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Irf9Q61179 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Irf9Q61179 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Irf9Q61179 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Irf9Q61179 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Irf9Q61179 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Irf9Q61179 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Irf9Q61179 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Irf9Q61179 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms