Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf3Q60980 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf3Q60980 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf3Q60980 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf3Q60980 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf3Q60980 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf3Q60980 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf3Q60980 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf3Q60980 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf3Q60980 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf3Q60980 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf3Q60980 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf3Q60980 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf3Q60980 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf3Q60980 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf3Q60980 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf3Q60980 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf3Q60980 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf3Q60980 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf3Q60980 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf3Q60980 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf3Q60980 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf3Q60980 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf3Q60980 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf3Q60980 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf3Q60980 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf3Q60980 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf3Q60980 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf3Q60980 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf3Q60980 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf3Q60980 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klf3Q60980 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klf3Q60980 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klf3Q60980 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klf3Q60980 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klf3Q60980 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klf3Q60980 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klf3Q60980 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Klf3Q60980 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klf3Q60980 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klf3Q60980 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klf3Q60980 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Klf3Q60980 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klf3Q60980 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klf3Q60980 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klf3Q60980 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klf3Q60980 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klf3Q60980 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klf3Q60980 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klf3Q60980 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klf3Q60980 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klf3Q60980 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klf3Q60980 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klf3Q60980 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klf3Q60980 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klf3Q60980 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klf3Q60980 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klf3Q60980 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klf3Q60980 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klf3Q60980 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klf3Q60980 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Klf3Q60980 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klf3Q60980 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klf3Q60980 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klf3Q60980 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klf3Q60980 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klf3Q60980 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klf3Q60980 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klf3Q60980 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klf3Q60980 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klf3Q60980 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klf3Q60980 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klf3Q60980 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klf3Q60980 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klf3Q60980 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klf3Q60980 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klf3Q60980 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klf3Q60980 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klf3Q60980 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klf3Q60980 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klf3Q60980 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klf3Q60980 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klf3Q60980 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klf3Q60980 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klf3Q60980 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klf3Q60980 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klf3Q60980 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klf3Q60980 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klf3Q60980 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klf3Q60980 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klf3Q60980 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klf3Q60980 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Klf3Q60980 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klf3Q60980 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klf3Q60980 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klf3Q60980 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klf3Q60980 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klf3Q60980 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klf3Q60980 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klf3Q60980 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms