Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbbp7Q60973 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbbp7Q60973 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbbp7Q60973 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbbp7Q60973 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbbp7Q60973 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbbp7Q60973 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbbp7Q60973 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbbp7Q60973 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbbp7Q60973 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbbp7Q60973 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rbbp7Q60973 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rbbp7Q60973 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms